Alametycyna - Alamethicin
Nazwy | |
---|---|
Nazwa IUPAC
N -acetylo-2-metyloalanylo- L -prolilo-2-metyloalanylo- L -alanylo-2-metyloalanylo- L- alanylo- L -glutaminyl-2-metyloalanylo- L -walilo-2-metyloalanyloglicylo- L -leucyl-2- methylalanyl- L -prolyl- L -valyl-2-methylalanyl-2-methylalanyl- L -α-glutamylu N 1 - [(1 S ) -1-benzylo-2-hydroksyetylo] - l -glutamamide
|
|
Identyfikatory | |
Model 3D ( JSmol )
|
|
CHEMBL | |
ChemSpider | |
Karta informacyjna ECHA | 100.121.626 |
Identyfikator klienta PubChem
|
|
UNII | |
Pulpit nawigacyjny CompTox ( EPA )
|
|
|
|
|
|
Nieruchomości | |
C 92 H 150 N 22 O 25 | |
Masa cząsteczkowa | 1964,31 g/mol |
Wygląd zewnętrzny | Białawe ciało stałe |
Temperatura topnienia | 255 do 270 °C (491 do 518 °F; 528 do 543 K) |
Nierozpuszczalny | |
Rozpuszczalność w DMSO , metanolu , etanolu | Rozpuszczalny |
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w ich stanie standardowym (przy 25 °C [77 °F], 100 kPa). |
|
zweryfikuj ( co to jest ?) | |
Referencje do infoboksu | |
Alameticin jest peptydowym antybiotykiem tworzącym kanały wytwarzanym przez grzyb Trichoderma viride . Należy do peptydów peptaibolowych, które zawierają nieproteinogenną resztę aminokwasową Aib ( kwas 2-aminoizomasłowy ). Ta pozostałość silnie indukuje tworzenie struktury alfa-helikalnej . Sekwencja peptydów to:
Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl
(Ac = acetyl, Phl = fenyloalaninol , Aib = kwas 2-aminoizomasłowy )
W błonach komórkowych tworzy zależne od napięcia kanały jonowe poprzez agregację czterech do sześciu cząsteczek .
Biosynteza
Przypuszcza się, że biosynteza alametycyny jest katalizowana przez syntazę alametycyny, nierybosomalną syntazę peptydową (NRPS) wyizolowaną po raz pierwszy w 1975 roku. Chociaż zaakceptowano kilka sekwencji peptydu alametycyny, dowody sugerują, że wszystkie one są zgodne z ogólnym mechanizmem NRPS z niewielkimi zmianami w wybranych aminokwasach . Zaczynając od acylowania N-końca pierwszego kwasu aminoizomasłowego enzymu syntazy ALM przez Acetyl-CoA , następuje sekwencyjna kondensacja aminokwasów przez każdą modułową jednostkę syntetazy. Aminokwasy są początkowo adenylowane przez domenę „ adenylacyjną ” (A), zanim zostaną przyłączone wiązaniem tioestrowym do białka nośnikowego peptydylowego podobnego do Acyl Carrier Protein . Rosnący łańcuch jest przyłączony do aminokwasu zawierającego PCP przez domenę „kondensacji” (C), po czym następuje kolejna runda tych samych reakcji w następnym module.
Całość dopełnia dodatek fenyloalaniny, niezwykłego substratu przypominającego aminokwas. Po dodaniu fenyloalaninylu kompletny łańcuch peptydowy jest rozszczepiany przez domenę tioesterazy, rozszczepiając wiązanie tioestrowe i pozostawiając alkohol.
Bibliografia
Dalsza lektura
- Jones, LR; Maddock, SW; Besch, HR Jr (1980). „Demaskujący wpływ alametycyny na (Na+,K+)-ATPazę, cyklazę adenylanową sprzężoną z receptorem beta-adrenergicznym i aktywność kinazy białkowej zależnej od cAMP w pęcherzykach mięsaka sercowego” . J. Biol. Chem . 255 (20): 9971–9980. doi : 10.1016/S0021-9258(18)43488-6 . PMID 6253461 .
- Poznaj struktury Alameticin w banku danych białkowych
-
Alametycyna w Norynie
- Z „Model kanału jonowego bramkowanego napięciem wywnioskowany ze struktury krystalicznej alametycyny przy rozdzielczości 1,5 A”. Fox Jr, RO; Richards, FM (1982). „Model kanału jonowego bramkowanego napięciem wywnioskowane ze struktury krystalicznej alametycyny w rozdzielczości 1,5 A”. Natura . 300 (5890): 325–30. Kod Bib : 1982Natur.300..325F . doi : 10.1038/300325a0 . PMID 6292726 . S2CID 4278453 .
- Leitgeb, Balázs; Szekeres, Andras; Manczinger, László; Vagvölgyi, Csaba; Kredics, László (2007-06-01). „Historia Alamethicin: przegląd najszerzej badanego Peptaibolu”. Chemia i bioróżnorodność . 4 (6): 1027–1051. doi : 10.1002/cbdv.200790095 . ISSN 1612-1880 . PMID 17589875 . S2CID 40886688 .