Alametycyna - Alamethicin

Alametycyna
Alameticin.png
Nazwy
Nazwa IUPAC
N -acetylo-2-metyloalanylo- L -prolilo-2-metyloalanylo- L -alanylo-2-metyloalanylo- L- alanylo- L -glutaminyl-2-metyloalanylo- L -walilo-2-metyloalanyloglicylo- L -leucyl-2- methylalanyl- L -prolyl- L -valyl-2-methylalanyl-2-methylalanyl- L -α-glutamylu N 1 - [(1 S ) -1-benzylo-2-hydroksyetylo] - l -glutamamide
Identyfikatory
Model 3D ( JSmol )
CHEMBL
ChemSpider
Karta informacyjna ECHA 100.121.626 Edytuj to na Wikidata
Identyfikator klienta PubChem
UNII
  • InChI=1S/C92H150N22O25/c1-47(2)43-58(72(127)108-92(24,25)84(139)113-41-29-33-59(113)73(128)103- 65(48(3)4)75(130)111-90(20,21)82(137)112-89(18,19)80(135)102-56(37-40-64(120)121) 70(125)101-55(35-38-61(93)117)69(124)98-54(46-115)44-53-31-27-26-28-32-53)99-63( 119)45-95-77(132)85(10,11)110-76(131)66(49(5)6)104-81(136)88(16,17)107-71(126)57( 36-39-62(94)118)100-67(122)50(7)96-78(133)86(12,13)106-68(123)51(8)97-79(134)87( 14,15)109-74(129)60-34-30-42-114(60)83(138)91(22,23)105-52(9)116/h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H,29-30,33-46H2,1-25H3,(H2,93,117)(H2,94,118)(H,95,132)(H,96,133)(H,97,134)(H ,98,124)(H,99,119)(H,100,122)(H,101,125)(H,102,135)(H,103,128)(H,104,136)(H,105,116)(H,106,123)(H,107,126)(H ,108,127)(H,109,129)(H,110,131)(H,111,130)(H,112,137)(H,120,121)/t50-,51-,54-,55-,56-,57-,58-, 59-,60-,65-,66-/m0/s1 sprawdzaćTak
    Klucz: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNSA-N sprawdzaćTak
  • InChI=1/C92H150N22O25/c1-47(2)43-58(72(127)108-92(24,25)84(139)113-41-29-33-59(113)73(128)103- 65(48(3)4)75(130)111-90(20,21)82(137)112-89(18,19)80(135)102-56(37-40-64(120)121) 70(125)101-55(35-38-61(93)117)69(124)98-54(46-115)44-53-31-27-26-28-32-53)99-63( 119)45-95-77(132)85(10,11)110-76(131)66(49(5)6)104-81(136)88(16,17)107-71(126)57( 36-39-62(94)118)100-67(122)50(7)96-78(133)86(12,13)106-68(123)51(8)97-79(134)87( 14,15)109-74(129)60-34-30-42-114(60)83(138)91(22,23)105-52(9)116/h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H,29-30,33-46H2,1-25H3,(H2,93,117)(H2,94,118)(H,95,132)(H,96,133)(H,97,134)(H ,98,124)(H,99,119)(H,100,122)(H,101,125)(H,102,135)(H,103,128)(H,104,136)(H,105,116)(H,106,123)(H,107,126)(H ,108,127)(H,109,129)(H,110,131)(H,111,130)(H,112,137)(H,120,121)/t50-,51-,54-,55-,56-,57-,58-, 59-,60-,65-,66-/m0/s1
    Klucz: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNBC
  • CC(C)C[C@@H](C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C( C)C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)N[C@H](CCC(=O)O)C( =O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)CO)NC(=O)CNC(=O )C(C)(C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)[C@H](CCC( =O)N)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C( C)(C)NC(=O)[C@H]3CCCN3C(=O)C(C)(C)NC(=O)C
  • CC(C)CC(C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCCC1C(=O)NC(C(C)C)C(=O)NC(C)(C)C( =O)NC(C)(C)C(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)NC(CCC(=O)N)C(=O)NC(Cc2ccccc2)CO)NC (=O)CNC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(CCC() =O)N)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(= O)C3CCCN3C(=O)C(C)(C)NC(=O)C
Nieruchomości
C 92 H 150 N 22 O 25
Masa cząsteczkowa 1964,31 g/mol
Wygląd zewnętrzny Białawe ciało stałe
Temperatura topnienia 255 do 270 °C (491 do 518 °F; 528 do 543 K)
Nierozpuszczalny
Rozpuszczalność w DMSO , metanolu , etanolu Rozpuszczalny
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w ich stanie standardowym (przy 25 °C [77 °F], 100 kPa).
☒n zweryfikuj  ( co to jest   ?) sprawdzaćTak☒n
Referencje do infoboksu

Alameticin jest peptydowym antybiotykiem tworzącym kanały wytwarzanym przez grzyb Trichoderma viride . Należy do peptydów peptaibolowych, które zawierają nieproteinogenną resztę aminokwasową Aib ( kwas 2-aminoizomasłowy ). Ta pozostałość silnie indukuje tworzenie struktury alfa-helikalnej . Sekwencja peptydów to:

Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl

(Ac = acetyl, Phl = fenyloalaninol , Aib = kwas 2-aminoizomasłowy )

W błonach komórkowych tworzy zależne od napięcia kanały jonowe poprzez agregację czterech do sześciu cząsteczek .

Biosynteza

Przypuszcza się, że biosynteza alametycyny jest katalizowana przez syntazę alametycyny, nierybosomalną syntazę peptydową (NRPS) wyizolowaną po raz pierwszy w 1975 roku. Chociaż zaakceptowano kilka sekwencji peptydu alametycyny, dowody sugerują, że wszystkie one są zgodne z ogólnym mechanizmem NRPS z niewielkimi zmianami w wybranych aminokwasach . Zaczynając od acylowania N-końca pierwszego kwasu aminoizomasłowego enzymu syntazy ALM przez Acetyl-CoA , następuje sekwencyjna kondensacja aminokwasów przez każdą modułową jednostkę syntetazy. Aminokwasy są początkowo adenylowane przez domenę „ adenylacyjną ” (A), zanim zostaną przyłączone wiązaniem tioestrowym do białka nośnikowego peptydylowego podobnego do Acyl Carrier Protein . Rosnący łańcuch jest przyłączony do aminokwasu zawierającego PCP przez domenę „kondensacji” (C), po czym następuje kolejna runda tych samych reakcji w następnym module.

tekst alternatywny
Ogólny mechanizm syntezy NRPS w alametycynie, pokazujący kondensację substratów aminokwasowych z modułu do modułu. Ac=Acetyl Aib=kwas aminoizomasłowy. Składniki modułu: A= adenylacja PCP= białko nośnika peptydylowego C=kondensacja

Całość dopełnia dodatek fenyloalaniny, niezwykłego substratu przypominającego aminokwas. Po dodaniu fenyloalaninylu kompletny łańcuch peptydowy jest rozszczepiany przez domenę tioesterazy, rozszczepiając wiązanie tioestrowe i pozostawiając alkohol.

tekst alternatywny
Schemat poszczególnych modułów i wydłużenia biosyntezy alametycyny. Dla każdego modułu pokazano rosnący łańcuch peptydowy, kończący się rozszczepieniem tioestru i wytworzeniem liniowej alametycyny. Ac=Acetyl Aib=Kwas aminoizomasłowy Pheol=Fenyloalaninol. Składniki modułu: A=Adenylacja PCP=Białko nośnika peptydylowego C=Kondensacja

Bibliografia

Dalsza lektura