David J. Patterson - David J. Patterson
David Joseph Patterson jest taksonomistą z Irlandii Północnej, specjalizującym się w pierwotniakach i zastosowaniu taksonomii w informatyce bioróżnorodności .
Wczesne życie i edukacja
David Joseph Patterson urodził się w Belfaście , Irlandii Północnej w dniu 19 kwietnia 1950 (z domu Doris Mary Bell) i Samuel Patterson, z jednym starszym bratem (matematyk Samuel James ) i siostry (Frances Mary). Ojciec Alice Mii Vørs Patterson, Daniela Kierana Pattersona i Williama Zhao Pattersona. Kształcił się w Belmont Primary, Strandtown i Grosvenor High Schools w Belfaście. Uzyskał tytuł Bachelor of Science z wyróżnieniem pierwszej klasy na Queen's University w Belfaście w 1971 roku.
Kariera
David Patterson uzyskał doktorat z filozofii na Uniwersytecie w Bristolu w 1976 roku, gdzie został później zatrudniony (1977-1993). Uzyskał doktorat z nauk ścisłych w 1990 roku na Queen's University w Belfaście. W 1993 roku przeniósł się na University of Sydney w Australii, gdzie został kierownikiem Szkoły Nauk Biologicznych. W 2004 roku przeniósł się do Laboratorium Biologii Morskiej w Woods Hole (Mass., USA), gdzie współtworzył projekt Encyklopedia Życia odpowiedzialny za komponent informatyczny, opierając EOL na modelu opracowanym w ramach projektu mikroskopu. W latach 2012-2014 był profesorem naukowym na Arizona State University; a także był profesorem (MBL) na Brown University w Providence, Rhode Island i jest emerytowanym profesorem Uniwersytetu Sydney, Sydney, Australia. Jako taksonomista interesuje się głównie różnorodnością pierwotniaków i ewolucją protistów. On i jego współpracownicy opisali około 250 nowych taksonów. David Patterson został odznaczony nagrodą Thomasa Henry'ego Huxleya oraz Medalem Naukowym Towarzystwa Zoologicznego w Londynie; był sekretarzem brytyjskiej sekcji Towarzystwa Protozoologów; Prezes Międzynarodowego Towarzystwa Protistologii Ewolucyjnej; i wiceprzewodniczący (Międzynarodowego) Towarzystwa Protozoologicznego. Był członkiem Międzynarodowej Komisji Nomenklatury Zoologicznej, członkiem Komitetu Wykonawczego Międzynarodowej Unii Nauk Biologicznych oraz członkiem Komitetu Naukowego Światowego Systemu Danych.
W swojej karierze opublikował około 200 recenzowanych artykułów, w tym kilka książek. Początkowe zainteresowania fizjologią jonów, regulacją objętości i wakuolami kurczliwymi przeniosły się na badania ultrastrukturalne, technikę, która zmieniła rozumienie różnorodności protistów, a następnie została dodatkowo wzbogacona przez porównawcze badania molekularne. Wraz z Guyem Brugerolle przedstawił swoją koncepcję, zgodnie z którą klady protistów można z powodzeniem zidentyfikować na podstawie dopełnienia i układu organelli - czyli ich ultrastrukturalnej tożsamości, a później wykorzystał tę koncepcję wraz z uzasadnieniem przekształconej kladystyki, aby na nowo zdefiniować różnorodność kladów wśród eukariontów. . Uprościło to wyzwanie ustanowienia kompletnej filogenezy dla eukariontów poprzez dostarczenie listy kladów, wśród których należało ustalić pokrewieństwo.
W połowie lat osiemdziesiątych Patterson skoncentrował swoje wysiłki na wolno żyjących heterotroficznych wiciowcach, ponieważ były one słabo poznane i nie były aktywnie badane. Dwa obszary badań były utrudnione z powodu braku świadomości różnorodności wiciowców. Pierwsza dotyczyła wyłaniającej się koncepcji sieci pokarmowych drobnoustrojów, która zmieniała ocenę dynamiki ekosystemów oceanicznych - sama w sobie miała kluczowe znaczenie dla międzynarodowego badania Joint Global Ocean Flux Study, którego celem było lepsze zrozumienie przepływów węgla i globalnego ocieplenia. Po drugie, ponieważ najbardziej prymitywne eukarionty nosiły wici, oczekiwano, że zrozumienie różnorodności różnorodności wiciowców pozwoli uzyskać lepszy wgląd w pochodzenie eukariotyczne i ewolucję. Wraz ze współpracownikami doprowadziło to do rozpoznania nowych domen różnorodności protistanów - takich jak stramenopiles , alveolates i excavata ( excavata ) - silnie zdefiniowanych przez odniesienie do amorfii, a następnie rzadkości w protistologii.
Patterson zbadał rodzącą się i w dużej mierze teoretyczną koncepcję, że większość drobnoustrojów powinna mieć uniwersalną dystrybucję, początkowo sformułowaną przez Lourensa Baasa Beckinga i odświeżoną przez Toma Fenchela i Blanda Finlaya . Stosując znormalizowane pobieranie próbek, dokumentację i protokoły sprawozdawcze, do społeczności w obszarach morskich, słodkowodnych i ekstremalnych, w lokalizacjach Pacyfiku i Atlantyku, na półkuli północnej i południowej, w siedliskach przybrzeżnych i głębokich osadach oceanicznych (itp.), odrzucił on i współpracownicy hipoteza, że skład taksonomiczny zbiorowisk wolno żyjących wiciowców był determinowany czynnikami geograficznymi. Ta wiedza wyeliminowała potrzebę tworzenia lokalnych katalogów i ekspertyz, przyspieszając badania taksonomiczne, filogenetyczne i ekologiczne z udziałem wiciowców.
W końcu jego zainteresowania przeniosły się na osadzanie wiedzy taksonomicznej w narzędziach do zarządzania informacjami o bioróżnorodności. Był starszym taksonomistą w projekcie Encyclopedia of Life, doradcą Fundacji Alfreda P. Sloana, coPI w ramach Data Conservancy i finansowanego przez NSF projektu Global Names oraz członkiem zespołu Plazi. Był głównym inicjatorem projektu Global Names Architecture .
Taksony nazwane jego imieniem obejmują Pattersoniella vitiphila , Foissner, 1987; Protoopalina pattersonii Delvinquier, 1995; Nuclearia pattersonii , Nerad, Silberman i in., 2008; Pseudovorticella pattersoni , Sun, Ji, Warren i Song 2009 oraz Stephanopogon pattersoni Lee Miller i Simpson, 2014.
Opisane taksony
Actinophrys salsuginosa Mikrjukov & Patterson, 2001 | Dingensia angusta Patterson & Zölffel, 1991 | Notosolenus hamelini Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 | Ploeotia adhaerens Larsen i Patterson, 1990 |
Actinophrys tauryanini Mikrjukov i Patterson, 2001 | Ambulatorium dyplomowego Larsen & Patterson, 1990 | Notosolenus hemicircularis Lee i Patterson, 2000 | Ploeotia amygdala Lee, Brandt, Vørs i Patterson, 2003 |
Adriamonas Verhagen, Zölffel, Brugerolle i Patterson, 1994 | Diplonema metabolicum Larsen i Patterson, 1990 | Notosolenus lashue Lee i Patterson, 2000 | Ploeotia azurina Patterson & Simpson, 1996 |
Adriamonas peritocrescens Verhagen, Zölffel, Brugerolle i Patterson, 1994 | Dolium Larsen i Patterson, 1990 | Notosolenus mediocanellatus Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 | Ploeotia corrugata Larsen & Patterson, 1990 |
Amphidiniopsis korewalensis Murray & Patterson, 2002 | Dolium sedentarium Larsen i Patterson, 1990 | Notosolenus navicula Larsen i Patterson, 1990 | Ploeotia decipiens Larsen & Patterson, 1990 |
Amphidinium boggayum Murray & Patterson, 2002 | Eufolliculina uhligi Mulisch & Patterson, 1983 | Notosolenus ostium Larsen i Patterson, 1990 | Ploeotia discoids Larsen i Patterson, 1990 |
Amphidinium corrugatum Larsen & Patterson, 1990 | Eumycetes Patterson, 1994 | Notosolenus pyriforme Lee i Patterson, 2000 | Ploeotia heracleum Larsen i Patterson, 1990 |
Amphidinium mootonorum Murray & Patterson, 2002 | Fromentella Patterson i Zölffel, 1991 | Notosolenus scutulum Larsen i Patterson, 1990 | Ploeotia laminae Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 |
Amphidinium yuroogurrum Murray & Patterson, 2002 | Fromentella granulosa Patterson & Zölffel, 1991 | Notosolenus steini Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 | Ploeotia longifilum Larsen & Patterson, 1990 |
Ancyromonas melba Patterson & Simpson, 1996 | Glissandra Patterson i Simpson, 1996 | Notosolenus tamanduensis Larsen i Patterson, 1990 | Ploeotia obliqua Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 |
Ancyromonas sinistrae Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 | Glissandra innuerende Patterson & Simpson, 1996 | Notosolenus triangularis Larsen i Patterson, 1990 | Ploeotia oblonga Larsen i Patterson, 1990 |
Anehmia Ekebom, Patterson i Vørs, 1996 | Goniomonas amphinema Larsen i Patterson, 1990 | Notosolenus urceolatus Larsen i Patterson, 1990 | Ploeotia plumosa Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 |
Anehmia egzotyczna Ekebom, Patterson i Vørs, 1996 | Goniomonas pacifica Larsen & Patterson, 1990 | Nuclearia flavescens Patterson, 1984 | Ploeotia pseudanisonema Larsen i Patterson, 1990 |
Anisonema glaciale Larsen i Patterson, 1990 | Gyrodinium oblongum Larsen & Patterson, 1990 | Nuclearia flavocapsulata Patterson, 1984 | Ploeotia punctata Larsen i Patterson, 1990 |
Apusomonas australiensis Ekelund i Patterson, 1997 | Heteronema exaratum Larsen i Patterson, 1990 | Nuclearia leuckarti Patterson, 1984 | Ploeotia robusta Larsen & Patterson, 1990 |
Astasia skvortzovi Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 | Heteronema larseni Lee i Patterson, 2000 | Nuclearia radians Patterson, 1984 | Ploeotia scrobiculata Larsen & Patterson, 1990 |
Axodines Patterson, 1994 | Heteronema pterbica Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 | Nuclearia ruber Patterson, 1984 | Ploeotia tasmanica Lee, Simpson i Patterson, 2005 |
Barthelona Bernard Simpson i Patterson, 2000 | Heteronema splendens Larsen i Patterson, 1990 | Palustrimonas yorkeensis Patterson & Simpson, 1996 | Ploeotia tenuis Larsen i Patterson, 1990 |
Barthelona vulgaris Bernard Simpson i Patterson, 2000 | Heteronema vittatum Larsen i Patterson, 1990 | Peranema dolichonema Larsen i Patterson, 1990 | Protaspis gemmifera Larsen i Patterson, 1990 |
Bodo cefaloporus Larsen i Patterson, 1990 | Jakoba Patterson, 1990 | Peranema dolichonema Larsen i Patterson, 1990 | Protaspis obliqua Larsen i Patterson, 1990 |
Bodo cygnus Patterson i Simpson, 1996 | Jakoba incarcerata Bernard Simpson i Patterson, 2000 | Peranema macrostoma Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 | Protaspis tegere Larsen & Patterson, 1990 |
Bodo platyrhynchus Larsen i Patterson, 1990 | Jakoba libera Patterson, 1990 | Percolomonas Fenchel i Patterson, 1986 | Protaspis verrucosa Larsen i Patterson, 1990 |
Bodo saliens Larsen i Patterson, 1990 | Jenningsia curvicauda Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas cosmopolitus Fenchel i Patterson, 1986 | Pseudoperanema dolichonema Larsen & Patterson, 1990 |
Bordnamonas Larsen i Patterson, 1990 | Jenningsia deflexum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas cuspidata Larsen i Patterson, 1990 | Pseudophyllomitus apiculatus Lee, 2002 r. |
Bordnamonas tropicana Larsen i Patterson, 1990 | Jenningsia furcatum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 | Percolomonas descissus Larsen i Patterson, 1990 | Pseudophyllomitus granulus Lee, 2002 |
Cabra Murray i Patterson, 2004 | Jenningsia fusiforme Lee, Blackmore i Patterson, 1999 | Percolomonas elephas Larsen i Patterson, 1990 | Pseudophyllomitus vesiculosis Lee, 2002 |
Cabra matta Murray i Patterson, 2004 | Jenningsia glabrum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 | Percolomonas membranifera Larsen i Patterson, 1990 | Pteridomonas danica Patterson i Fenchel, 1985 |
Caecitellus Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993 | Jenningsia granuliferum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 | Percolomonas pyriformis Larsen i Patterson, 1990 | Quasibodo Bernard Simpson & Patterson, 2000 |
Caecitellus parvulus Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993 | Jenningsia kupfferi Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas salinus Larsen i Patterson, 1990 | Quasibodo laughtoni Bernard Simpson i Patterson, 2000 |
Kafeteria Fenchel & Patterson, 1988 | Jenningsia limax Lee, Blackmore i Patterson, 1999 | Percolomonas similis Lee, Brandt, Vørs & Patterson, 2003 | Ramicristates Patterson, 1994 |
Kafeteria ligulifera Larsen & Patterson, 1990 | Jenningsia macer Lee, Blackmore i Patterson, 1999 | Percolomonas spinosus Larsen i Patterson, 1990 | Rhabdomonas mirabilis Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 |
Kafeteria minuta Larsen & Patterson, 1990 | Jenningsia macrostomum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 | Percolomonas sulcatus Larsen i Patterson, 1990 | Rhinodinium Murray, Hoppenrath, Preisfeld, Larsen, Yoshimatsu, Topriumi i Patterson, 2006 |
Kafeteria roenbergensis Fenchel & Patterson, 1988 | Jenningsia nigrum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 | Petalomonas boadicea Larsen i Patterson, 1990 | Rhinodinium broomeensis Murray, Hoppenrath, Preisfeld, Larsen, Yoshimatsu, Topriumi i Patterson, 2006 |
Carpediemonas Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 | Jenningsia sacculus Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Petalomonas calycimonoides Lee i Patterson, 2000 | Rhizomonas setigera Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993 |
Carpediemonas bialata Lee i Patterson, 2000 | Kamera Patterson i Zölffel, 1991 | Petalomonas christeni Lee i Patterson, 2000 | Rhynchobodo simius Patterson i Simpson, 1996 |
Carpediemonas membranifera Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 | Obiektyw kamery Patterson & Zölffel, 1991 | Petalomonas compressa Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 | Sciviamonas Ekelund, Patterson i Vørs w Ekelund i Patterson, 1997 |
Centroheliozoa Patterson, 1994 | Kiitoksia kaloista Tong, Vørs & Patterson, 1997 | Petalomonas intortus Lee & Patterson, 2000 | Sciviamonas terricola Ekelund, Patterson i Vørs w Ekelund i Patterson, 1997 |
Cercomonas granulus Lee & Patterson, 2000 | Macappella Patterson i Zölffel, 1991 | Petalomonas iugosus Lee i Patterson, 2000 | Slabyrinthulids Patterson, 1994 |
Chlamydaster fimbriatus Dürrschmidt & Patterson, 1987 | Massisteria Larsen i Patterson, 1990 | Petalomonas labrum Lee i Patterson, 2000 | Slanimals Patterson 1985 |
Ciliophrys azurina Mikrjukov i Patterson, 2001 | Massisteria marina Larsen & Patterson, 1990 | Petalomonas marginalis Larsen & Patterson, 1990 | Sloomycetes Patterson, 1985 |
Clautrivia cavus Lee i Patterson, 2000 | Mastigamoeba psammobia Larsen i Patterson, 1990 | Petalomonas minor Larsen & Patterson, 1990 | Slopalinida Patterson, 1985 |
Colpodella turpis Simpson & Patterson, 1996 | Mastigamoeba punctachora Bernard Simpson i Patterson, 2000 | Petalomonas physaloides Lee i Patterson, 2000 | Sphenomonas alburiae Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 |
Colpodella unguis Patterson & Simpson, 1996 | Mastigamoeba schizofrenia Simpson, Bernard, Fenchel i Patterson, 1997 | Petalomonas planus Lee i Patterson, 2000 | Stramenochromy Patterson, 1989 |
Cristamonadida Brugerolle & Patterson | Metafolliculina baletnica Mulisch, Harry, Patterson & Wyatt, 1986 | Petalomonas poosilla Larsen i Patterson, 1990 | Stramenopiles Patterson, 1994 |
Cryptaulax elegans Larsen i Patterson, 1990 | Metopion Larsen i Patterson, 1990 | Petalomonas quinquecarinata Lee i Patterson, 2000 | Tetradimorpha pterbica Mikrjukov i Patterson, w Mikrjukovie, 2000 |
Dinema dimorphum Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 | Metopion fluens Larsen i Patterson, 1990 | Petalomonas raiula Larsen i Patterson, 1990 | Thecamonas Larsen i Patterson, 1990 |
Dinema inaequale Larsen i Patterson, 1990 | Metromonas Larsen i Patterson, 1990 | Petalomonas spinifera Lee i Patterson, 2000 | Thecamonas filosa Larsen i Patterson, 1990 |
Dinema litorale Larsen i Patterson, 1990 | Metromonas grandis Larsen i Patterson, 1990 | Petalomonas virgatus Lee i Patterson, 2000 | Thecamonas mutabilis Larsen i Patterson, 1990 |
Dinema maculata Larsen i Patterson, 1990 | Metromonas simplex Larsen i Patterson, 1990 | Petalomonas virgatus Lee i Patterson, 2000 | Thecamonas trahens Larsen i Patterson, 1990 |
Dinema platysomum Lee i Patterson, 2000 | Ministeria Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993 | Phyllomitus granulatus Larsen & Patterson, 1990 | Toshiba Patterson i Zölffel, 1991 |
Dinema validum Larsen i Patterson, 1990 | Ministeria marisola Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993 | Phyllomitus vesiculosus Larsen i Patterson, 1990 | Toshiba vorax Patterson & Zölffel, 1991 |
Dinematomonas inaequale Larsen i Patterson, 1990 | Monotrichomony Bernard Simpson i Patterson, 2000 | Platychilomonas Larsen i Patterson, 1990 | Trimastix inaequalis Bernard Simpson i Patterson, 2000 |
Dinematomonas litorale Larsen i Patterson, 1990 | Monotrichomonas carabina Bernard Simpson i Patterson, 2000 | Platychilomonas psammobia Larsen i Patterson, 1990 | Urceolus cornutus Larsen i Patterson, 1990 |
Dinematomonas maculata Larsen i Patterson, 1990 | Notosolenus adamus Lee i Patterson, 2000 | Plaustrimonas Patterson i Simpson, 1996 | Urceolus costatus Larsen i Patterson, 1990 |
Dinematomonas valida Larsen i Patterson, 1990 | Notosolenus alatellus Larsen & Patterson, 1990 | Pleurostomum turgidum Patterson & Simpson, 1996 | |
Dingensia Patterson i Zölffel, 1991 | Notosolenus brothernis Lee i Patterson, 2000 | Ploeotia adhaerens Larsen & Patterson, 1990 |