David J. Patterson - David J. Patterson

David Joseph Patterson jest taksonomistą z Irlandii Północnej, specjalizującym się w pierwotniakach i zastosowaniu taksonomii w informatyce bioróżnorodności .

David J. Patterson, wyspa Sylt, 1992

Wczesne życie i edukacja

David Joseph Patterson urodził się w Belfaście , Irlandii Północnej w dniu 19 kwietnia 1950 (z domu Doris Mary Bell) i Samuel Patterson, z jednym starszym bratem (matematyk Samuel James ) i siostry (Frances Mary). Ojciec Alice Mii Vørs Patterson, Daniela Kierana Pattersona i Williama Zhao Pattersona. Kształcił się w Belmont Primary, Strandtown i Grosvenor High Schools w Belfaście. Uzyskał tytuł Bachelor of Science z wyróżnieniem pierwszej klasy na Queen's University w Belfaście w 1971 roku.

Kariera

David Patterson uzyskał doktorat z filozofii na Uniwersytecie w Bristolu w 1976 roku, gdzie został później zatrudniony (1977-1993). Uzyskał doktorat z nauk ścisłych w 1990 roku na Queen's University w Belfaście. W 1993 roku przeniósł się na University of Sydney w Australii, gdzie został kierownikiem Szkoły Nauk Biologicznych. W 2004 roku przeniósł się do Laboratorium Biologii Morskiej w Woods Hole (Mass., USA), gdzie współtworzył projekt Encyklopedia Życia odpowiedzialny za komponent informatyczny, opierając EOL na modelu opracowanym w ramach projektu mikroskopu. W latach 2012-2014 był profesorem naukowym na Arizona State University; a także był profesorem (MBL) na Brown University w Providence, Rhode Island i jest emerytowanym profesorem Uniwersytetu Sydney, Sydney, Australia. Jako taksonomista interesuje się głównie różnorodnością pierwotniaków i ewolucją protistów. On i jego współpracownicy opisali około 250 nowych taksonów. David Patterson został odznaczony nagrodą Thomasa Henry'ego Huxleya oraz Medalem Naukowym Towarzystwa Zoologicznego w Londynie; był sekretarzem brytyjskiej sekcji Towarzystwa Protozoologów; Prezes Międzynarodowego Towarzystwa Protistologii Ewolucyjnej; i wiceprzewodniczący (Międzynarodowego) Towarzystwa Protozoologicznego. Był członkiem Międzynarodowej Komisji Nomenklatury Zoologicznej, członkiem Komitetu Wykonawczego Międzynarodowej Unii Nauk Biologicznych oraz członkiem Komitetu Naukowego Światowego Systemu Danych.

W swojej karierze opublikował około 200 recenzowanych artykułów, w tym kilka książek. Początkowe zainteresowania fizjologią jonów, regulacją objętości i wakuolami kurczliwymi przeniosły się na badania ultrastrukturalne, technikę, która zmieniła rozumienie różnorodności protistów, a następnie została dodatkowo wzbogacona przez porównawcze badania molekularne. Wraz z Guyem Brugerolle przedstawił swoją koncepcję, zgodnie z którą klady protistów można z powodzeniem zidentyfikować na podstawie dopełnienia i układu organelli - czyli ich ultrastrukturalnej tożsamości, a później wykorzystał tę koncepcję wraz z uzasadnieniem przekształconej kladystyki, aby na nowo zdefiniować różnorodność kladów wśród eukariontów. . Uprościło to wyzwanie ustanowienia kompletnej filogenezy dla eukariontów poprzez dostarczenie listy kladów, wśród których należało ustalić pokrewieństwo.

W połowie lat osiemdziesiątych Patterson skoncentrował swoje wysiłki na wolno żyjących heterotroficznych wiciowcach, ponieważ były one słabo poznane i nie były aktywnie badane. Dwa obszary badań były utrudnione z powodu braku świadomości różnorodności wiciowców. Pierwsza dotyczyła wyłaniającej się koncepcji sieci pokarmowych drobnoustrojów, która zmieniała ocenę dynamiki ekosystemów oceanicznych - sama w sobie miała kluczowe znaczenie dla międzynarodowego badania Joint Global Ocean Flux Study, którego celem było lepsze zrozumienie przepływów węgla i globalnego ocieplenia. Po drugie, ponieważ najbardziej prymitywne eukarionty nosiły wici, oczekiwano, że zrozumienie różnorodności różnorodności wiciowców pozwoli uzyskać lepszy wgląd w pochodzenie eukariotyczne i ewolucję. Wraz ze współpracownikami doprowadziło to do rozpoznania nowych domen różnorodności protistanów - takich jak stramenopiles , alveolates i excavata ( excavata ) - silnie zdefiniowanych przez odniesienie do amorfii, a następnie rzadkości w protistologii.

Patterson zbadał rodzącą się i w dużej mierze teoretyczną koncepcję, że większość drobnoustrojów powinna mieć uniwersalną dystrybucję, początkowo sformułowaną przez Lourensa Baasa Beckinga i odświeżoną przez Toma Fenchela i Blanda Finlaya . Stosując znormalizowane pobieranie próbek, dokumentację i protokoły sprawozdawcze, do społeczności w obszarach morskich, słodkowodnych i ekstremalnych, w lokalizacjach Pacyfiku i Atlantyku, na półkuli północnej i południowej, w siedliskach przybrzeżnych i głębokich osadach oceanicznych (itp.), odrzucił on i współpracownicy hipoteza, że ​​skład taksonomiczny zbiorowisk wolno żyjących wiciowców był determinowany czynnikami geograficznymi. Ta wiedza wyeliminowała potrzebę tworzenia lokalnych katalogów i ekspertyz, przyspieszając badania taksonomiczne, filogenetyczne i ekologiczne z udziałem wiciowców.

W końcu jego zainteresowania przeniosły się na osadzanie wiedzy taksonomicznej w narzędziach do zarządzania informacjami o bioróżnorodności. Był starszym taksonomistą w projekcie Encyclopedia of Life, doradcą Fundacji Alfreda P. Sloana, coPI w ramach Data Conservancy i finansowanego przez NSF projektu Global Names oraz członkiem zespołu Plazi. Był głównym inicjatorem projektu Global Names Architecture .

Taksony nazwane jego imieniem obejmują Pattersoniella vitiphila , Foissner, 1987; Protoopalina pattersonii Delvinquier, 1995; Nuclearia pattersonii , Nerad, Silberman i in., 2008; Pseudovorticella pattersoni , Sun, Ji, Warren i Song 2009 oraz Stephanopogon pattersoni Lee Miller i Simpson, 2014.

Opisane taksony

Taksony nazwane Davidem J. Pattersonem wśród autorów
Actinophrys salsuginosa Mikrjukov & Patterson, 2001 Dingensia angusta Patterson & Zölffel, 1991 Notosolenus hamelini Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 Ploeotia adhaerens Larsen i Patterson, 1990
Actinophrys tauryanini Mikrjukov i Patterson, 2001 Ambulatorium dyplomowego Larsen & Patterson, 1990 Notosolenus hemicircularis Lee i Patterson, 2000 Ploeotia amygdala Lee, Brandt, Vørs i Patterson, 2003
Adriamonas Verhagen, Zölffel, Brugerolle i Patterson, 1994 Diplonema metabolicum Larsen i Patterson, 1990 Notosolenus lashue Lee i Patterson, 2000 Ploeotia azurina Patterson & Simpson, 1996
Adriamonas peritocrescens Verhagen, Zölffel, Brugerolle i Patterson, 1994 Dolium Larsen i Patterson, 1990 Notosolenus mediocanellatus Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 Ploeotia corrugata Larsen & Patterson, 1990
Amphidiniopsis korewalensis Murray & Patterson, 2002 Dolium sedentarium Larsen i Patterson, 1990 Notosolenus navicula Larsen i Patterson, 1990 Ploeotia decipiens Larsen & Patterson, 1990
Amphidinium boggayum Murray & Patterson, 2002 Eufolliculina uhligi Mulisch & Patterson, 1983 Notosolenus ostium Larsen i Patterson, 1990 Ploeotia discoids Larsen i Patterson, 1990
Amphidinium corrugatum Larsen & Patterson, 1990 Eumycetes Patterson, 1994 Notosolenus pyriforme Lee i Patterson, 2000 Ploeotia heracleum Larsen i Patterson, 1990
Amphidinium mootonorum Murray & Patterson, 2002 Fromentella Patterson i Zölffel, 1991 Notosolenus scutulum Larsen i Patterson, 1990 Ploeotia laminae Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002
Amphidinium yuroogurrum Murray & Patterson, 2002 Fromentella granulosa Patterson & Zölffel, 1991 Notosolenus steini Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 Ploeotia longifilum Larsen & Patterson, 1990
Ancyromonas melba Patterson & Simpson, 1996 Glissandra Patterson i Simpson, 1996 Notosolenus tamanduensis Larsen i Patterson, 1990 Ploeotia obliqua Schroeckh, Lee i Patterson, 2003
Ancyromonas sinistrae Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 Glissandra innuerende Patterson & Simpson, 1996 Notosolenus triangularis Larsen i Patterson, 1990 Ploeotia oblonga Larsen i Patterson, 1990
Anehmia Ekebom, Patterson i Vørs, 1996 Goniomonas amphinema Larsen i Patterson, 1990 Notosolenus urceolatus Larsen i Patterson, 1990 Ploeotia plumosa Ekebom, Patterson & Vørs, 1996
Anehmia egzotyczna Ekebom, Patterson i Vørs, 1996 Goniomonas pacifica Larsen & Patterson, 1990 Nuclearia flavescens Patterson, 1984 Ploeotia pseudanisonema Larsen i Patterson, 1990
Anisonema glaciale Larsen i Patterson, 1990 Gyrodinium oblongum Larsen & Patterson, 1990 Nuclearia flavocapsulata Patterson, 1984 Ploeotia punctata Larsen i Patterson, 1990
Apusomonas australiensis Ekelund i Patterson, 1997 Heteronema exaratum Larsen i Patterson, 1990 Nuclearia leuckarti Patterson, 1984 Ploeotia robusta Larsen & Patterson, 1990
Astasia skvortzovi Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 Heteronema larseni Lee i Patterson, 2000 Nuclearia radians Patterson, 1984 Ploeotia scrobiculata Larsen & Patterson, 1990
Axodines Patterson, 1994 Heteronema pterbica Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 Nuclearia ruber Patterson, 1984 Ploeotia tasmanica Lee, Simpson i Patterson, 2005
Barthelona Bernard Simpson i Patterson, 2000 Heteronema splendens Larsen i Patterson, 1990 Palustrimonas yorkeensis Patterson & Simpson, 1996 Ploeotia tenuis Larsen i Patterson, 1990
Barthelona vulgaris Bernard Simpson i Patterson, 2000 Heteronema vittatum Larsen i Patterson, 1990 Peranema dolichonema Larsen i Patterson, 1990 Protaspis gemmifera Larsen i Patterson, 1990
Bodo cefaloporus Larsen i Patterson, 1990 Jakoba Patterson, 1990 Peranema dolichonema Larsen i Patterson, 1990 Protaspis obliqua Larsen i Patterson, 1990
Bodo cygnus Patterson i Simpson, 1996 Jakoba incarcerata Bernard Simpson i Patterson, 2000 Peranema macrostoma Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 Protaspis tegere Larsen & Patterson, 1990
Bodo platyrhynchus Larsen i Patterson, 1990 Jakoba libera Patterson, 1990 Percolomonas Fenchel i Patterson, 1986 Protaspis verrucosa Larsen i Patterson, 1990
Bodo saliens Larsen i Patterson, 1990 Jenningsia curvicauda Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas cosmopolitus Fenchel i Patterson, 1986 Pseudoperanema dolichonema Larsen & Patterson, 1990
Bordnamonas Larsen i Patterson, 1990 Jenningsia deflexum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas cuspidata Larsen i Patterson, 1990 Pseudophyllomitus apiculatus Lee, 2002 r.
Bordnamonas tropicana Larsen i Patterson, 1990 Jenningsia furcatum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 Percolomonas descissus Larsen i Patterson, 1990 Pseudophyllomitus granulus Lee, 2002
Cabra Murray i Patterson, 2004 Jenningsia fusiforme Lee, Blackmore i Patterson, 1999 Percolomonas elephas Larsen i Patterson, 1990 Pseudophyllomitus vesiculosis Lee, 2002
Cabra matta Murray i Patterson, 2004 Jenningsia glabrum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 Percolomonas membranifera Larsen i Patterson, 1990 Pteridomonas danica Patterson i Fenchel, 1985
Caecitellus Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993 Jenningsia granuliferum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 Percolomonas pyriformis Larsen i Patterson, 1990 Quasibodo Bernard Simpson & Patterson, 2000
Caecitellus parvulus Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993 Jenningsia kupfferi Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas salinus Larsen i Patterson, 1990 Quasibodo laughtoni Bernard Simpson i Patterson, 2000
Kafeteria Fenchel & Patterson, 1988 Jenningsia limax Lee, Blackmore i Patterson, 1999 Percolomonas similis Lee, Brandt, Vørs & Patterson, 2003 Ramicristates Patterson, 1994
Kafeteria ligulifera Larsen & Patterson, 1990 Jenningsia macer Lee, Blackmore i Patterson, 1999 Percolomonas spinosus Larsen i Patterson, 1990 Rhabdomonas mirabilis Schroeckh, Lee i Patterson, 2003
Kafeteria minuta Larsen & Patterson, 1990 Jenningsia macrostomum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 Percolomonas sulcatus Larsen i Patterson, 1990 Rhinodinium Murray, Hoppenrath, Preisfeld, Larsen, Yoshimatsu, Topriumi i Patterson, 2006
Kafeteria roenbergensis Fenchel & Patterson, 1988 Jenningsia nigrum Lee, Blackmore i Patterson, 1999 Petalomonas boadicea Larsen i Patterson, 1990 Rhinodinium broomeensis Murray, Hoppenrath, Preisfeld, Larsen, Yoshimatsu, Topriumi i Patterson, 2006
Carpediemonas Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 Jenningsia sacculus Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Petalomonas calycimonoides Lee i Patterson, 2000 Rhizomonas setigera Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993
Carpediemonas bialata Lee i Patterson, 2000 Kamera Patterson i Zölffel, 1991 Petalomonas christeni Lee i Patterson, 2000 Rhynchobodo simius Patterson i Simpson, 1996
Carpediemonas membranifera Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 Obiektyw kamery Patterson & Zölffel, 1991 Petalomonas compressa Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 Sciviamonas Ekelund, Patterson i Vørs w Ekelund i Patterson, 1997
Centroheliozoa Patterson, 1994 Kiitoksia kaloista Tong, Vørs & Patterson, 1997 Petalomonas intortus Lee & Patterson, 2000 Sciviamonas terricola Ekelund, Patterson i Vørs w Ekelund i Patterson, 1997
Cercomonas granulus Lee & Patterson, 2000 Macappella Patterson i Zölffel, 1991 Petalomonas iugosus Lee i Patterson, 2000 Slabyrinthulids Patterson, 1994
Chlamydaster fimbriatus Dürrschmidt & Patterson, 1987 Massisteria Larsen i Patterson, 1990 Petalomonas labrum Lee i Patterson, 2000 Slanimals Patterson 1985
Ciliophrys azurina Mikrjukov i Patterson, 2001 Massisteria marina Larsen & Patterson, 1990 Petalomonas marginalis Larsen & Patterson, 1990 Sloomycetes Patterson, 1985
Clautrivia cavus Lee i Patterson, 2000 Mastigamoeba psammobia Larsen i Patterson, 1990 Petalomonas minor Larsen & Patterson, 1990 Slopalinida Patterson, 1985
Colpodella turpis Simpson & Patterson, 1996 Mastigamoeba punctachora Bernard Simpson i Patterson, 2000 Petalomonas physaloides Lee i Patterson, 2000 Sphenomonas alburiae Schroeckh, Lee i Patterson, 2003
Colpodella unguis Patterson & Simpson, 1996 Mastigamoeba schizofrenia Simpson, Bernard, Fenchel i Patterson, 1997 Petalomonas planus Lee i Patterson, 2000 Stramenochromy Patterson, 1989
Cristamonadida Brugerolle & Patterson Metafolliculina baletnica Mulisch, Harry, Patterson & Wyatt, 1986 Petalomonas poosilla Larsen i Patterson, 1990 Stramenopiles Patterson, 1994
Cryptaulax elegans Larsen i Patterson, 1990 Metopion Larsen i Patterson, 1990 Petalomonas quinquecarinata Lee i Patterson, 2000 Tetradimorpha pterbica Mikrjukov i Patterson, w Mikrjukovie, 2000
Dinema dimorphum Schroeckh, Lee i Patterson, 2003 Metopion fluens Larsen i Patterson, 1990 Petalomonas raiula Larsen i Patterson, 1990 Thecamonas Larsen i Patterson, 1990
Dinema inaequale Larsen i Patterson, 1990 Metromonas Larsen i Patterson, 1990 Petalomonas spinifera Lee i Patterson, 2000 Thecamonas filosa Larsen i Patterson, 1990
Dinema litorale Larsen i Patterson, 1990 Metromonas grandis Larsen i Patterson, 1990 Petalomonas virgatus Lee i Patterson, 2000 Thecamonas mutabilis Larsen i Patterson, 1990
Dinema maculata Larsen i Patterson, 1990 Metromonas simplex Larsen i Patterson, 1990 Petalomonas virgatus Lee i Patterson, 2000 Thecamonas trahens Larsen i Patterson, 1990
Dinema platysomum Lee i Patterson, 2000 Ministeria Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993 Phyllomitus granulatus Larsen & Patterson, 1990 Toshiba Patterson i Zölffel, 1991
Dinema validum Larsen i Patterson, 1990 Ministeria marisola Patterson, Nygaard, Steinberg & Turley, 1993 Phyllomitus vesiculosus Larsen i Patterson, 1990 Toshiba vorax Patterson & Zölffel, 1991
Dinematomonas inaequale Larsen i Patterson, 1990 Monotrichomony Bernard Simpson i Patterson, 2000 Platychilomonas Larsen i Patterson, 1990 Trimastix inaequalis Bernard Simpson i Patterson, 2000
Dinematomonas litorale Larsen i Patterson, 1990 Monotrichomonas carabina Bernard Simpson i Patterson, 2000 Platychilomonas psammobia Larsen i Patterson, 1990 Urceolus cornutus Larsen i Patterson, 1990
Dinematomonas maculata Larsen i Patterson, 1990 Notosolenus adamus Lee i Patterson, 2000 Plaustrimonas Patterson i Simpson, 1996 Urceolus costatus Larsen i Patterson, 1990
Dinematomonas valida Larsen i Patterson, 1990 Notosolenus alatellus Larsen & Patterson, 1990 Pleurostomum turgidum Patterson & Simpson, 1996
Dingensia Patterson i Zölffel, 1991 Notosolenus brothernis Lee i Patterson, 2000 Ploeotia adhaerens Larsen & Patterson, 1990

Bibliografia