eEF-1 - eEF-1

Centralny region kwasowy czynnika wydłużenia 1 beta, eukariota
Identyfikatory
Symbol EF1_beta_acid
Pfam PF10587
InterPro IPR018940
MĄDRY SM01182
Czynnik elongacji translacji EF1B, podjednostka beta/delta, domena wymiany nukleotydów guaninowych
Identyfikatory
Symbol EF1_GNE
Pfam PF00736
InterPro IPR014038
MĄDRY SM00888
CDD cd00292

eEF-1 to dwa eukariotyczne czynniki wydłużania . Tworzy dwa kompleksy, homolog EF-Tu EF-1A i homolog EF- Ts EF-1B , czynnik wymiany guanidów tego pierwszego. Oba znajdują się również w archeonach .

Struktura

Nomenklatura podjednostek eEF-1 zmieniła się nieco około 2001 roku, ponieważ uznano, że kompleksy EF-1A i EF-1B są do pewnego stopnia niezależne od siebie. Obecnie rozpoznawane i nazwane komponenty obejmują:

Aktualna nomenklatura Stara Nomenklatura Ludzkie geny Funkcja kanoniczna
eEF1A eEF1α EEF1A1 , EEF1A2
EEF1A1P43 		dostarczanie aa-tRNA do rybosomu; asocjuje z kompleksem syntazy aa-tRNA.
eEF1Bα eEF1β (zwierzę, grzyby)
eEF1β' (roślina) 		EEF1B2
EEF1B2P1 , EEF1B2P2 , EEF1B2P3 		GEF dla eEF1A.
eEF1Bβ eEF1β (roślina) (Nic) Dodatkowy GEF dla eEF1A w roślinach o aktywności kontrolowanej przez kinazę CDF.
eEF1Bγ eEF1γ EEF1G Element konstrukcyjny.
eEF1Bδ eEF1δ EEF1D Dodatkowy GEF dla eEF1A u zwierząt.
eEF1ε eEF1ε EEF1E1 Naprawdę nie jest to czynnik wydłużenia. Rusztowanie dla kompleksu syntazy aa-tRNA.
Val-RS Val-RS VARS Syntetaza walilo-tRNA wiąże eEF1Bδ u królików.

Dokładny sposób, w jaki podjednostka eEF1B przyłącza się do eEF1A, różni się w zależności od narządu i gatunku. eEF1A wiąże również aktynę .

Inne gatunki

Różne gatunki zielenic , krasnorostów , chromalweolatów i grzybów nie posiadają genu EF-1α, ale posiadają pokrewny gen zwany EFL (podobny do czynnika wydłużenia). Chociaż jego funkcja nie została dogłębnie zbadana, wydaje się być podobna do EF-1α.

Od 2009 roku wiadomo, że tylko dwa organizmy posiadają zarówno EF-1α, jak i EFL: grzyb Basidiobolus i okrzemka Thalassiosira . Historia ewolucyjna EFL jest niejasna. Może pojawić się raz lub więcej razy, po czym następuje utrata EFL lub EF-1α. Według przeglądu z 2009 r. obecność w trzech różnych grupach eukariotycznych (grzyby, chromalweolany i archaeplastida ) ma być wynikiem dwóch lub więcej horyzontalnych zdarzeń transferu genów . W raporcie z 2013 r. znaleziono jeszcze 11 gatunków z obydwoma genami i przedstawiono alternatywną hipotezę, że przodek eukariota może mieć oba geny. We wszystkich znanych organizmach, w których obecne są oba geny, EF-1α ma tendencję do tłumienia transkrypcji. Jeśli hipoteza jest prawdziwa, naukowcy spodziewaliby się znaleźć organizm, który ma stłumiony EFL i w pełni funkcjonujący EF-1α.

Przegląd z 2014 r. EF-1α/EFL posiadający eukarionty uważa, że ​​oba wyjaśnienia same w sobie są niewystarczające, aby wyjaśnić złożoną dystrybucję tych dwóch białek u eukariontów.

U eukariontów w terminacji translacji uczestniczy pokrewna GTPaza zwana eRF3 . Z drugiej strony archeon EF-1α pełni wszystkie funkcje niesione przez te subfunkcjonalizowane warianty.

Zobacz też

Bibliografia

Zewnętrzne linki