Hipodrobnoustroje - Hyphomicrobiales
| Hipodrobnoustroje | |
|---|---|
|
|
| Agrobacterium (obraz SEM) | |
| Klasyfikacja naukowa | |
| Królestwo: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: |
Hipodrobnoustroje
Douglas 1957 (Listy Zatwierdzone 1980)
|
| Rodziny | |
|
Zobacz tekst |
|
| Synonimy | |
|
|
W Hyphomicrobiales stanowią porządek z Gram-ujemnych Alphaproteobacteria .
Rhizobium , które wiązania azotu i są symbiotyczne z korzeniami roślin, pojawiają się w różnych rodzinach. Cztery rodziny nitrobacteraceae , Hyphomicrobiaceae , phyllobacteriaceae i Rhizobiaceae zawiera co najmniej kilku rodzajów w azot, roślin strączkowych nodulating , microsymbiotic bakterii . Przykładami są rodzaje Bradyrhizobium i Rhizobium . Gatunki Methylocystaceae są metanotrofami ; wykorzystują metanol (CH 3 OH) lub metan (CH 4 ) jako jedyne źródło energii i węgla. Inne ważne rodzaje to patogeny człowieka Bartonella i Brucella oraz Agrobacterium (przydatne w inżynierii genetycznej ).
Taksonomia
Akceptowane rodziny
- Aestuariivirgaceae Li et al . 2019
- Afifellaceae Hördt i in . 2020
- Ahrensiaceae Hördt i in . 2020
- Alsobacteraceae Sun et al . 2018
- Amorphaceae Hördt i in . 2020
- Ancalomicrobiaceae Dahal i in . 2018
- Aurantimonadaceae Hördt i in . 2020
- Bartonellaceae Gieszczykiewicz 1939 (Listy zatwierdzone 1980)
- Beijerinckiaceae Garrity et al . 2006
- Blastochloridaceae Hördt i in . 2020
- Boseaceae Hördt i in . 2020
- Breoghaniaceae Hördt i in . 2020
- Brucellaceae Breed i in . 1957 (Listy Zatwierdzone 1980)
- Chelatococcaceae Dedysh et al . 2016
- Cohaesibacteraceae Hwang i Cho 2008
- Devosiaceae Hördt i in . 2020
- Hyphomicrobiaceae Babudieri 1950 (zatwierdzone listy 1980)
- Kaistiaceae Hördt i in . 2020
- Lichenibacteriaceae Pankratov et al . 2020
- Lichenihabitantaceae Noh i in . 2019
- Methylobacteriaceae Garrity et al . 2006
- Methylocystaceae Bowman 2006
- Nitrobacteraceae corrig. Buchanan 1917 (Listy Zatwierdzone 1980)
- Notoacmeibacteraceae Huang i in . 2017
- Parvibaculaceae Hördt i in . 2020
- Phreatobacteraceae Hördt i in . 2020
- Phyllobacteriaceae Mergaert i huśtawki 2006
- Pleomorphomonadaceae Hördt et al . 2020
- Pseudoxanthobacteraceae Hördt et al . 2020
- Rhabdaerophilaceae Ming i in . 2020
- Rhizobiaceae Conn 1938 (zatwierdzone listy 1980)
- Rhodobiaceae Garrity i in . 2006
- Roseiarcaceae Kulichevskaya et al . 2014
- Salinarimonadaceae Cole i in . 2018
- Segnochrobactraceae Akter et al . 2020
- Stappiaceae Hördt i in . 2020
- Tepidamorphaceae Hördt i in . 2020
- Xanthobacteraceae Lee i in . 2005
Nieprzypisany rodzaj
Następujący rodzaj nie został przypisany do rodziny:
- Flaviflagellibacter Dong i in . 2019
Tymczasowe taksony
Te taksony zostały opublikowane, ale nie zostały zwalidowane zgodnie z Kodeksem Bakteriologicznym :
- „ Nordella ” La Scola i in . 2004
- " Propylenellaceae " Liu i in . 2021
- „ Propylenella ” Liu i in . 2021
- " Propylenella binzhouense " Liu i in . 2021
- „ Propylenella ” Liu i in . 2021
- " Thermopetrobacter " Sislak 2013
Filogeneza
Obecnie przyjęta taksonomia oparta jest na Liście nazw prokariotycznych z Standing in Nomenclature, a filogeneza oparta jest na sekwencjach całego genomu.
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Naturalna transformacja genetyczna
Naturalną transformację genetyczną odnotowano u co najmniej czterech gatunków Hyphomicrobiales : Agrobacterium tumefaciens , Methylobacterium organophilum , Ensifer adhaerens i Bradyrhizobium japonicum . Naturalna transformacja genetyczna jest procesem płciowym obejmującym transfer DNA z jednej komórki bakteryjnej do drugiej przez pośrednie medium oraz integrację sekwencji dawcy z genomem biorcy przez rekombinację homologiczną .
Zobacz też
Uwagi
Bibliografia
Dalsza lektura
- Kuykendall LD, Dazzo FB (2005). „ Allorhizobium ”. W Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (red.). Alfa-, Beta-, Delta- i Epsilonproteobacteria, The Proteobacteria, część C, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . 2 (wyd. 2). Springer, Nowy Jork, NY. s. 345-346. Numer ISBN 978-0-387-24144-9.
- Kuykendalla LD (2005). „Rodzaj Azorhizobium ”. W Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (red.). Alfa-, Beta-, Delta- i Epsilonproteobacteria, The Proteobacteria, część C, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . 2 (wyd. 2). Springer, Nowy Jork, NY. s. 505-506. Numer ISBN 978-0-387-24144-9.
- Kuykendalla LD (2005). "Genus Bradyrhizobium , rodzina Bradyrhizobiaceae ' ". W Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (red.). Alfa-, Beta-, Delta- i Epsilonproteobacteria, The Proteobacteria, część C, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . 2 (wyd. 2). Springer, Nowy Jork, NY. s. 438-443. Numer ISBN 978-0-387-24144-9.
- Kuykendall LD, Young JM, Martínez-Romero, Kerr A, Sawada H (2005). „Rodzaj Rhizobium , bardzo rozbieżny rodzaj w zmienionej rodzinie”. W Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (red.). Alfa-, Beta-, Delta- i Epsilonproteobacteria, The Proteobacteria, część C, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . 2 (wyd. 2). Springer, Nowy Jork, NY. s. 324-340. Numer ISBN 978-0-387-24144-9.
- Chen WX, Wang ET, Kuykendall LD (2005). „enus Mesorhizobium , rodzina Photobacteriaceae”. W Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (red.). Alfa-, Beta-, Delta- i Epsilonproteobacteria, The Proteobacteria, część C, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . 2 (wyd. 2). Springer, Nowy Jork, NY. s. 403-408. Numer ISBN 978-0-387-24144-9.