Iridoviridae -Iridoviridae
| Iridoviridae | |
|---|---|
|
|
| Mikrograf TEM przedstawiający klaster wirionów Iridowirusa | |
Klasyfikacja wirusów 
|
|
| (bez rankingu): | Wirus |
| Królestwo : | Varidnaviria |
| Królestwo: | Bamfordvirae |
| Gromada: | Nucleocytoviricota |
| Klasa: | Megaviricetes |
| Zamówienie: | Pimascovirales |
| Rodzina: | Iridoviridae |
| Podrodziny i rodzaje | |
|
Zobacz tekst |
|
Iridoviridae to rodzina wirusów o dwuniciowychgenomach DNA . Płazy, ryby i bezkręgowce, takie jak stawonogi, są naturalnymi żywicielami. Obecnie w tej rodzinie są 22 gatunki, podzielone na dwie podrodziny i siedem rodzajów.
Nomenklatura
Nazwa pochodzi od Iris , na greckiej bogini z tęczy . Nazwę tę wybrano ze względu na „tęczową” opalizację obserwowaną u silnie zakażonych owadów i osadzonych próbek irydowirusów bezkręgowców . Może odnosić się do dowolnego członka rodziny Iridoviridae lub określonego rodzaju w obrębie Iridoviridae .
Taksonomia
Rozpoznawane są następujące podrodziny i rodzaje (- virinae oznacza podrodzinę, a - wirus oznacza rodzaj):
Struktura
Że wiriony są dwudziestościan z numerem triangulacji (T) = 189-217, 120-350 nm średnicy, a składa się z trzech domen: zewnętrznej białkowy kapsydu , związek pośredni lipidów błonowych, i rdzeń zawierający kompleksy DNA-białko. Niektóre wirusy mają również otoczkę zewnętrzną. Obecność lub brak otoczki zależy od tego, czy pączkowały z błony komórkowej (wirusy otoczkowe), czy też były ułożone w układy parakrystaliczne w cytoplazmie komórki gospodarza, a następnie zostały uwolnione przez lizę komórkową (wirusy bez otoczki).
Genom liniowy ma długość od 150 do 303 kilozasad . Zawiera sekwencje końcowe i nadmiarowe i jest permutowane kołowo.
Członkowie tej rodziny różnią się stopniem metylacji genomu . Rodzaje Chloriridovirus i Iridovirus nie mają wysoce zmetylowanego genomu. Członkowie Lymphocystivirus , Megalocytivirus i Ranavirus ma genom o około 25% ich cytozyny pozostałości metylowane przez wirusowo kodowaną DNA metylotransferazy .
| Rodzaj | Struktura | Symetria | Układ genomowy | Segmentacja genomowa |
|---|---|---|---|---|
| Limfocystywirus | Wielościenny | T=189–217 | Liniowy | Jednostronny |
| Megalocytywirus | Wielościenny | T=189–217 | Liniowy | Jednostronny |
| Ranawirus | Wielościenny | T=133 lub 147 | Liniowy | Jednostronny |
| Irydowirus | Wielościenny | T=147 | Liniowy | Jednostronny |
| Chlorirydowirus | Wielościenny | T=189–217 | Liniowy | Jednostronny |
Ekspresja genu
Podobnie jak w przypadku wirusów opryszczki , transkrypcja zachodzi w trzech etapach: natychmiastowy-wczesny, opóźniony-wczesny i późny. Na każdym etapie istnieją mechanizmy pozytywnej indukcji i negatywnego sprzężenia zwrotnego, w których pośredniczą produkty innych etapów.
Replikacja
Cząsteczki wirusa dostają się do komórki i następuje odsłonięcie. Wirusowy DNA jest transportowany do jądra komórki gospodarza , gdzie jest transkrybowany przez polimerazę RNA gospodarza II zmodyfikowaną przez wirusa. Tymczasem synteza makromolekularna gospodarza ustaje.
Macierzyste DNA wytwarza genom, który jest następnie matrycą do replikacji w cytoplazmie . W wyniku rekombinacji w cytoplazmie powstają duże konkatemery wirusowego DNA. Pakowanie nowych genomów w wiriony zachodzi w cytoplazmie, a wirus jest uwalniany albo przez pączkowanie z błony komórkowej, albo przez lizę komórki.
| Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wejścia | Szczegóły wydania | Witryna replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Limfocystywirus | Ryba | Nic | Endocytoza receptora komórkowego | Liza; początkujący | Jądro | Cytoplazma | Nieznany |
| Megalocytywirus | Ryba | Nic | Endocytoza receptora komórkowego | Liza; początkujący | Jądro | Cytoplazma | Nieznany |
| Ranawirus | żaby; węże | Nic | Endocytoza receptora komórkowego | Liza; początkujący | Jądro | Cytoplazma | Kontakt |
| Irydowirus | Owady | Nic | Endocytoza receptora komórkowego | Liza; początkujący | Jądro | Cytoplazma | Kontakt |
| Chlorirydowirus | Muchówki ze stadium larw wodnych, głównie komarów | Nic | Endocytoza receptora komórkowego | Początkujący | Jądro | Cytoplazma | Nieznany |
Patogeneza
Niewiele wiadomo na temat patogenezy irydowirusów. Patogeneza jest jednak zależna od temperatury i dlatego irydowirusy są ograniczone do gospodarzy poikilotermicznych .
Zakres hostów
Członkowie rodziny Iridoviridae zarażają głównie bezkręgowce , ale także niektóre gatunki kręgowców, takie jak ryby, płazy i gady.
Bibliografia
MicrobiologyBytes: Iridoviruses , zarchiwizowane z oryginału 24 lutego 2007 , pobrane 2007-03-06 Viral Bioinformatics Resource Center & Viral Bioinformatics – Canada, University of Victoria , zarchiwizowane od oryginału 17 sierpnia 2007 , pobrane 2007-03-06