John Woodland Hastings - John Woodland Hastings
John Woodland Hastings | |
---|---|
Urodzić się |
|
24 marca 1927
Zmarł | 6 sierpnia 2014 |
(w wieku 87 lat)
Narodowość | amerykański |
Obywatelstwo | Stany Zjednoczone |
Alma Mater |
Swarthmore College , 1944-1947; BA 1947 ( program szkolenia oficerów medycznych Navy V-12 )
Uniwersytet Princeton , 1948-1951; mgr 1950, dr hab. 1951 Johns Hopkins University , 1951-1953 podoktoranckie Fellow |
Znany z | Założenie biologii okołodobowej |
Nagrody | NATO Senior Fellow in Science, Foundation Curie, Orsay, Francja, 1977 |
Kariera naukowa | |
Pola | Bioluminescencja , Rytmy dobowe |
Instytucje | Instruktor nauk biologicznych Northwestern University 1953-1957
Adiunkt Biochemistry University of Illinois 1957-1966 Profesor Biologii Harvard University , 1966-1986; Paul C. Mangelsdorf profesor nauk przyrodniczych Harvard University 1986 - 2014 |
Praca dyplomowa | Stężenie tlenu i intensywność bioluminescencji (1951) |
Doradca doktorski | E. Newton Harvey |
Inni doradcy akademiccy | William D. McElroy |
John Woodland „ Woody ” Hastings , (24 marca 1927 – 6 sierpnia 2014) był liderem w dziedzinie fotobiologii , zwłaszcza bioluminescencji , i był jednym z założycieli dziedziny biologii okołodobowej (badanie rytmów okołodobowych lub cykl snu i czuwania). Był Paul C. Mangelsdorf Profesor Nauk Przyrodniczych i profesor Molekularnej i Komórkowej Biologii na Uniwersytecie Harvarda . Opublikował ponad 400 artykułów i współredagował trzy książki.
Badania Hastings nad bioluminescencją koncentrowały się głównie na luminescencji bakteryjnej (ponad 150 artykułów) i bruzdnicach (ponad 80 artykułów). Oprócz bakterii i wiciowce, on, z jego uczniów i współpracowników, opublikowane także dokumenty dotyczące biochemicznych i molekularnych mechanizmów wytwarzania światła w grzyby, cnidarians , ctenophores , wieloszczetów , owadów ( świetliki i muchówek ), małżoraczków skorupiaki , stonogi , osłonic , i ryby z bakteryjnymi organami świetlnymi. Jego laboratorium dostarczyło pierwszych dowodów na wykrywanie kworum u bakterii, wczesnych dowodów na molekularne mechanizmy regulacji zegara dobowego w organizmach (najpierw przy użyciu luminescencji bruzdnicy, a następnie rozszerzonej na inne białka komórkowe ), a także niektóre z początkowych badań transferu energii w zielonej fluorescencji białka (GFP) w luminescencji parzydełkowej .
Wczesne życie
Hastings mieszkał w Seaford, Delaware we wczesnym dzieciństwie; w 1937 wstąpił do chóru w katedrze św. Jana Bożego i uczęszczał do chóralnej szkoły z internatem, odwiedzając swoją rodzinę podczas wakacji. Hastings przeniósł się do Lenox School w Lenox w stanie Massachusetts w 1941 roku, aby ukończyć szkołę średnią i interesował się literaturą, fizyką, matematyką, hokejem na lodzie i koszykówką.
Nagrody i wyróżnienia
W swojej karierze Hastings otrzymał liczne nagrody i wyróżnienia:
- Stypendysta Guggenheima , 1965;
- Wybrany do Johns Hopkins Society of Scholars, 1969;
- Wybrany do Amerykańskiej Akademii Sztuki i Nauki , 1972;
- starszy pracownik naukowy NATO , Foundation Curie, Orsay, Francja, 1977;
- Alexander von Humboldt Fellow , Bonn , Niemcy 1979-80 i 1993;
- Stypendysta Fundacji Yamada, Osaka , Japonia, 1986;
- Nagroda za zasługi NIMH , 1990 i 1994;
- Fellow w American Academy of Microbiology , 2003;
- Nagroda American Society for Photobiology Lifetime Achievement Award, 2003;
- Wybrany do Narodowej Akademii Nauk , 2003;
- Laureat nagrody Farrella w dziedzinie medycyny snu za wkład w tworzenie dziedziny rytmów okołodobowych, 2006.
Kariera zawodowa
Hastings rozpoczął studia podyplomowe na Uniwersytecie Princeton w 1948 roku w laboratorium E. Newtona Harveya , ówczesnego światowego lidera badań luminescencji, i skupił się na roli tlenu w luminescencji bakterii, świetlików, skorupiaków i grzybów. Doktoryzował się w 1951 roku. Następnie dołączył do laboratorium Williama D. McElroya , innego studenta Harvey's, na Uniwersytecie Johnsa Hopkinsa, gdzie odkrył zarówno stymulujący wpływ koenzymu A, jak i kontrolę bramkowania przez tlen luminescencji świetlików, i że flawina jest substrat w luminescencji bakteryjnej.
W 1953 rozpoczął pracę na Wydziale Nauk Biologicznych Northwestern University . W 1954 rozpoczął długą współpracę z Beatrice M. Sweeney , która pracowała wówczas w Scripps Institution of Oceanography , w wyjaśnianiu komórkowych i biochemicznych mechanizmów luminescencji jednokomórkowego bruzdnicy Lingulodinium polyedrum (wcześniej znanej jako Gonyaulax polyedra ). Produktem ubocznym tych wstępnych badań było odkrycie dobowej kontroli luminescencji.
W 1957 Hastings następnie objął stanowisko wydziału w Dziale Biochemii Wydziału Chemii na Uniwersytecie Illinois w Urbana-Champaign, gdzie kontynuował swoją koncentrację na bruzdnicach i luminescencji bakteryjnej oraz rytmach dobowych bruzdnic. Hastings dołączył do wydziału Uniwersytetu Harvarda jako profesor biologii w 1966 roku. W tym okresie kontynuował i poszerzał swoje badania nad rytmami okołodobowymi bruzdnic i luminescencją u bakterii, bruzdnic i innych organizmów. Został wybrany do Narodowej Akademii Nauk w 2003 roku i otrzymał nagrodę Farrella w dziedzinie medycyny snu za pracę nad rytmami okołodobowymi w 2006 roku.
Przez ponad 50 lat był również związany z Marine Biological Laboratory w Woods Hole, Massachusetts. Był tam kierownikiem Kursu Fizjologii w latach 1962-1966, aw latach 1966-1970 pełnił funkcję powiernika.
zainteresowania badawcze
Bakterie luminescencyjne : Hastings ' badania bakterii świecących działała jako katalizator odkryć biochemicznego mechanizmów biorących udział w ich świetle produkcji odkrycie flawiny się podłoże w lucyferazy reakcji oznaczanie genów regulacji lucyferazy i pierwszy dowód na wykrywanie kworum , formę komunikacji bakteryjnej. W quorum sensing (początkowo określanym jako autoindukcja) bakterie uwalniają substancję do pożywki, autoinduktor. Gdy stężenie tej substancji osiągnie poziom krytyczny (miara liczby bakterii na ograniczonym obszarze), włączana jest transkrypcja określonych innych genów, które zostały stłumione. Po odkryciu, że sekwencjonowany gen autoinduktora występuje powszechnie w bakteriach Gram-ujemnych, na początku lat 90. zaakceptowano wykrywanie kworum. Obecnie wiadomo, że u wielu bakterii chorobotwórczych dochodzi do opóźnionego wytwarzania toksyn , które znacznie zwiększają ich patogenność, podobnie jak w przypadku białek lucyferazy. Ograniczając produkcję toksyn do czasu, gdy populacja bakterii będzie znaczna, bakterie te mogą szybko wytwarzać ogromne ilości toksyn, a tym samym zalać obronę gospodarza.
Luminescencyjne bruzdnice : Na początku 1954 roku na Northwestern University w Hastings, jego studenci i współpracownicy badali komórkowe i molekularne aspekty bioluminescencji bruzdnic [zwłaszcza Lingulodinium polyedrum (dawniej Gonyaulax polyedra )]. Wyjaśnili struktury lucyferyn i lucyferaz , organizację i regulację powiązanych z nimi genów, mechanizmy kontroli czasowej oraz rzeczywistą tożsamość subkomórkową i lokalizację elementów emitujących światło, które nazwali scyntylami . Wykazali, że reakcja jest kontrolowana przez spadek pH, gdy potencjał czynnościowy prowadzi do wejścia protonów przez aktywowane napięciem kanały błony w scyntylonach. Poprzez badania immunolokalizacji laboratorium Hastingsa wykazało, że scyntylony są małymi pęcherzykami obwodowymi (0,4 μm), które zawierają zarówno lucyferazę, jak i białko wiążące lucyferynę. Niedawno laboratorium odkryło, że gen lucyferazy w Lingulodinium polyedrum i innych blisko spokrewnionych gatunkach zawiera trzy homologiczne i ciągłe powtarzające się sekwencje w rodzaju „cyrku z trzema pierścieniami, który działa we wszystkich trzech”. Jednak inny luminescencyjny, ale heterotroficzny bruzdnica, Noctiluca scintillans , ma tylko jedno białko, które wydaje się mieć zarówno właściwości katalityczne, jak i właściwości wiązania substratu w jednym, a nie oddzielnych białkach.
Rytmy okołodobowe bruzdnic : Wykorzystując jako model Lingulodinium polyedrum , Hastings zapoczątkował nasze zrozumienie mechanizmów molekularnych związanych z kontrolą rytmów okołodobowych, które u ludzi są związane ze snem, zmianą strefy czasowej i innymi codziennymi czynnościami. Jego laboratorium wykazało, że rytm bioluminescencji obejmuje codzienną syntezę i niszczenie białek. Ponieważ mRNA kodujące te białka pozostają niezmienione od dnia do nocy, synteza tych białek jest kontrolowana na poziomie translacyjnym . Ta praca została teraz rozszerzona na inne białka w komórce. Z drugiej strony, krótkie impulsy inhibitorów syntezy tych białek powodują przesunięcia fazowe rytmu okołodobowego, opóźnione lub przyśpieszone, w zależności od podania impulsu. Na jeszcze innym poziomie inhibitory fosforylacji białek wpływają również na okres rytmu.
Inne systemy luminescencyjne : Na początku swojej kariery Hastings opracował techniki ilościowego określania poziomu tlenu wymaganego w reakcji luminescencyjnej dla kilku różnych gatunków, w tym bakterii, grzybów, świetlików i skorupiaków. Ta praca wykazała, że bramkowanie tlenu jest mechanizmem migania świetlików. W innej pracy, kiedy był w laboratorium McElroya, zbadał podstawowy mechanizm biochemiczny lucyferazy świetlika i wykazał, że koenzym A stymuluje emisję światła. Jego laboratorium po raz pierwszy wykazało, że zielona bioluminescencja koelenteratu in vivo występuje z powodu przeniesienia energii z cząsteczki luminescencyjnej ( ekworyny ), która jako jedyna emituje niebieskie światło, do wtórnego zielonego emitera, który nazwali zielonym białkiem fluorescencyjnym (GFP). Po scharakteryzowaniu i sklonowaniu GFP stał się kluczową cząsteczką wykorzystywaną jako narzędzie reporterowe i znakujące do badania aktywacji genów i wzorców rozwojowych. Osamu Shimomura , Martin Chalfie i Roger Tsien otrzymali w 2008 roku Nagrodę Nobla w dziedzinie chemii za pracę nad tą niezwykłą cząsteczką.
Śmierć
Hastings zmarł na zwłóknienie płuc 6 sierpnia 2014 r. w Lexington w stanie Massachusetts .
Publikacje
Wybrane publikacje:
- Hastings, JW (2007). „ Zegar Gonyaulax na 50: translacyjna kontrola ekspresji okołodobowej” . Cold Spring Harb Symp Quant Biol . 72 : 141–144. doi : 10.1101/sqb.2007,72.026 . PMID 18419271 .
- Hastings, JW; Morin, JG (2006). „Fotony do zgłaszania zdarzeń molekularnych: zielone białko fluorescencyjne i cztery systemy lucyferazy”. Metody Biochem Anal . Metody analizy biochemicznej. 47 : 15–38. doi : 10.1002/0471739499.ch2 . Numer ISBN 9780471739494. PMID 16335708 .
- Nealson, KH; Hastings, JW (2006). „Quorum sensing w skali globalnej: ogromna liczba bakterii bioluminescencyjnych tworzy mleczne morza” . Zał. Otaczać. Mikrobiol . 72 (4): 2295–2297. doi : 10.1128/aem.72.4.2295-2297.2006 . PMC 1448986 . PMID 16597922 .
- Liu, L.; Wilsona, T.; Hastings, JW (2004). „Molekularna ewolucja lucyferaz Dinofflagellate, enzymów z trzema domenami katalitycznymi w jednym polipeptydzie” . Proc. Natl. Acad. Nauka. Stany Zjednoczone . 101 (47): 16555-16560. Kod Bib : 2004PNAS..10116555L . doi : 10.1073/pnas.0407597101 . PMC 534537 . PMID 15545598 .
- Okamoto, OK; Hastings, JW (grudzień 2003). „Analiza całego genomu genów regulowanych redoks w bruzdnicy”. Gen . 321 : 73–81. doi : 10.1016/j.gene.2003.07.003 . PMID 14636994 .
- Okamoto, OK; Hastings, JW (2003). „Nowe geny związane z zegarem bruzdnicowym zidentyfikowane poprzez analizę mikromacierzy”. Czasopismo Fykologii . 39 (3): 519-526. doi : 10.1046/j.1529-8817.2003.02170.x . S2CID 83666855 .
- Viviani, VR; Hastings, JW; Wilson, T. (2002). „Dwa bioluminescencyjne muchówki: północnoamerykańska Orfelia fultoni i australijska Arachnocampa flava . Podobna nisza, różne systemy bioluminescencji”. Fotochem. Fotobiol . 75 (1): 22–27. doi : 10.1562/0031-8655(2002)075<0022:tbdtna>2.0.co;2 . PMID 11837324 .
- Okamoto, OK; Liu, L; Robertson, DL; Hastings, JW (grudzień 2001). „Członkowie rodziny genów lucyferazy Dinofflagellate różnią się w synonimicznych stawkach substytucji”. Biochemia . 40 (51): 15862-8. doi : 10.1021/bi011651q . PMID 11747464 .
- Okamoto, OK; Robertson, DL; Fagan, TF; Hastings, JW; Colepicolo, P (czerwiec 2001). „Różne mechanizmy regulacyjne modulują ekspresję dinoflagellate dysmutazy żelaza nadtlenkowej” . J. Biol. Chem . 276 (23): 19989-93. doi : 10.1074/jbc.M101169200 . PMID 11264289 .
- Hastings, JW i Wood, KV (2001) Nie wszystkie lucyferazy wyewoluowały z prekursorów o podobnych właściwościach enzymatycznych. s. 199–210, In, Photobiology 2000 (D. Valenzeno i T. Coohill, red.) Valdenmar Publ. Co., Overland Park, KS.
- Hastings, JW (2001). „Pięćdziesiąt lat zabawy”. J. Biol. Rytmy . 16 (1): 5-18. doi : 10.1177/074873040101600102 . PMID 11220778 . S2CID 35410216 .
- Hastings, JW; Greenberg, EP (1999). „Quorum Sensing: Wyjaśnienie dziwnego zjawiska ujawnia wspólną cechę bakterii” . J. Bakteriol . 181 (9): 2667–2668. doi : 10.1128/JB.181.9.2667-2668.1999 . PMC 93702 . PMID 10217751 .
- Comolli, J.; Hastings, JW (1999). „Nowe efekty na okołodobowym systemie Gonyaulax wytwarzanym przez inhibitor kinazy białkowej Staurosporine”. J. Biol. Rytmy . 14 (1): 10–18. doi : 10.1177/074873099129000399 . PMID 10036988 . S2CID 16522583 .
- Wilsona, T.; Hastings, JW (1998). "Bioluminescencja". Annu. Rev. Cell Dev. Biol . 14 : 197–230. doi : 10.1146/annurev.cellbio.14.1.197 . PMID 9891783 .
- Hastings, JW (1996). „Chemia i kolory reakcji bioluminescencyjnych: przegląd”. Gen . 173 (1 specyfikacja nr): 5-11. doi : 10.1016/0378-1119(95)00676-1 . PMID 8707056 .
- Morse'a, D.; Milosa, premiera; Roux, E.; Hastings, JW (1989). „Dobowa regulacja syntezy białka wiążącego substrat w systemie bioluminescencyjnym Gonyaulax obejmuje kontrolę translacyjną” . Proc. Natl. Acad. Nauka. Stany Zjednoczone . 86 (1): 172–176. doi : 10.1073/pnas.86.1.172 . PMC 286426 . PMID 2911566 .
- Mikołaja, MT; Mikołaj G.; Johnsona, CH; Bassot, JM.; Hastings, JW (1987). „Charakterystyka organelli bioluminescencyjnych w Gonyaulax polyedra . (wiciowce brunatne ) po utrwaleniu metodą szybkiego zamrażania i wybarwieniu antylucyferazą immunogoldem” . J. Cell Biol . 105 (2): 723-735. doi : 10.1083/jcb.105.2.723 . PMC 2114768 . PMID 2442172 .
- Johnsona, CH; Hastings, JW (1986). „Nieuchwytny mechanizm zegara dobowego”. Amerykański naukowiec . 74 (1): 29–36. Kod Bibcode : 1986AmSci..74...29H .
- Hastings, JW (1983). „Różnorodność biologiczna, mechanizmy chemiczne i ewolucyjne pochodzenie systemów bioluminescencyjnych”. Journal of Molecular Evolution . 19 (5): 309–321. doi : 10.1007/bf02101634 . PMID 6358519 . S2CID 875590 .
- Taylora, WR; Dunlap, JC; Hastings, JW (1982). „Inhibitory syntezy białek na rybosomach lat 80. przesuwają fazę zegara Gonyaulax.”. J. Eksp. Biol . 97 : 121-136. doi : 10.1242/jeb.97.1.121 . PMID 7201003 .
- Dunlap, J.; Hastings, JW (1981). „Zegar biologiczny w Gonyaulax . kontroluje aktywność lucyferazy poprzez regulację obrotów” . J. Biol. Chem . 256 (20): 10509–10518. doi : 10.1016/S0021-9258(19)68651-5 . PMID 7197271 .
- Nealsona, KH; Hastings, JW (1979). „Bioluminescencja bakteryjna: jej kontrola i znaczenie ekologiczne” . Mikrobiol. ks . 43 (4): 396–518. doi : 10.1128/mmbr.43.4.496-518.1979 . PMC 281490 . PMID 396467 .
- McMurry, L.; Hastings, JW (1972). „Rytmy dobowe : mechanizm zmian aktywności lucyferazy w Gonyaulax ” . Biol. Byk . 143 (1): 196–206. doi : 10.2307/1540339 . JSTOR 1540339 . PMID 5049021 .
- Fogel, M.; Hastings, JW (1972). „Bioluminescencja: Mechanizm i sposób kontroli aktywności scyntylona” . Proc. Natl. Acad. Nauka . 69 (3): 690–693. Kod bib : 1972PNAS...69..690F . doi : 10.1073/pnas.69.3.690 . PMC 426536 . PMID 4501583 .
- Morin, JG; Hastings, JW (1971). „Transfer energii w systemie bioluminescencyjnym”. J. Komórka. Fizjol . 77 (3): 313–318. doi : 10.1002/jcp.1040770305 . PMID 4397528 . S2CID 42494355 .
- Nealson, K.; Platt, T.; Hastings, JW (1970). „Komórkowa kontrola syntezy i aktywności bakteryjnego układu luminescencyjnego” . J. Bakteriol . 104 (1): 313–322. doi : 10.1128/JB.104.1.313-322.1970 . PMC 248216 . PMID 5473898 .
- Wilson, T. i Hastings, JW (1970) Chemiczne i biologiczne aspekty wzbudzonego singletowego tlenu cząsteczkowego. Fotofizjologia (AC Giese, red.), tom. V, s. 49–95, Acad. Prasa, Nowy Jork.
- Hastings, JW; Mitchell, GW; Matująco, PH; Miga, JR; Van Leeuwen, M. (1969). „Odpowiedź bioluminescencji ekworyny na szybkie zmiany stężenia wapnia”. Natura . 222 (5198): 1047-1050. Kod Bibcode : 1969Natur.222.1047H . doi : 10.1038/2221047a0 . PMID 4389183 . S2CID 4182048 .
- Hastings, JW Bioluminescencja. (1968) Annu. Ks. Biochem. 37: 597-630.
- Krieger, N.; Hastings, JW (1968). „Bioluminescencja: profile aktywności pH powiązanych frakcji lucyferazy”. Nauka . 161 (3841): 586-589. Kod Bibcode : 1968Sci...161..586K . doi : 10.1126/nauka.161.3841.586 . PMID 5663301 . S2CID 40295305 .
- Hastings, JW; Gibson, QH (1963). „Półprodukty w bioluminescencyjnym utlenianiu zredukowanego mononukleotydu flawiny” . J. Biol. Chem . 238 (7): 2537-2554. doi : 10.1016/S0021-9258(19)68004-X . PMID 13960925 .
- Bode, VC; DeSa, RJ; Hastings, JW (1963). „Rytm dzienny aktywności lucyferyny w Gonyaulax polyedra ”. Nauka . 141 (3584): 913-915. Kod Bibcode : 1963Sci...141..913B . doi : 10.1126/nauka.141.3584.913 . PMID 17844013 . S2CID 11378699 .
- DeSa, RJ; Hastings, JW; Vatter, AE (1963). „Luminescencyjne cząstki „krystaliczne”: zorganizowany subkomórkowy system bioluminescencyjny”. Nauka . 141 (3587): 1269-1270. Kod Bibcode : 1963Sci...141.1269D . doi : 10.1126/science.141.3587.1269 . PMID 14059774 . S2CID 34981177 .
- Hastings, JW (1959). „Zegary jednokomórkowe”. Annu. Rev. Microbiol . 13 : 297–312. doi : 10.1146/annurev.mi.13.100159.001501 .
- Hastings, JW; Sweeney, BM (1957). „Reakcja luminescencyjna w ekstraktach z morskiej bruzdnicy Gonyaulax polyedra ”. J. Komórka. komp. Fizjol . 49 (2): 209–226. doi : 10.1002/jcp.1030490205 . PMID 13481063 .
- Sweeney, BM; Hastings, JW (1957). „Charakterystyka dobowego rytmu luminescencji w poliedrze Gonyaulax ”. J. Komórka. komp. Fizjol . 49 : 115–128. doi : 10.1002/jcp.1030490107 .
- McElroya, WD; Hastings, JW; Sonnenfeld V.; Coulombre, J. (1953). „Wymaganie fosforanu ryboflawiny dla luminescencji bakteryjnej”. Nauka . 118 (3066): 385-386. Kod Bibcode : 1953Sci...118..385M . doi : 10.1126/science.118.3066.385 . PMID 13101761 .
- Hastings, JW; McElroya, WD; Coulombre, J. (1953). „Wpływ tlenu na reakcję unieruchomienia w luminescencji świetlika”. J. Komórka. komp. Fizjol . 42 (1): 137-150. doi : 10.1002/jcp.1030420109 . PMID 13084711 .
- Hastings, JW (1952b). „Stężenie tlenu i intensywność bioluminescencji II: Cypridina hilgendorfii ”. J. Komórka. komp. Fizjol . 40 (1): 1–9. doi : 10.1002/jcp.1030400102 . PMID 12981130 .
- Hastings, JW (1952a). „Stężenie tlenu i intensywność bioluminescencji. I: Bakterie i grzyby”. J. Komórka. komp. Fizjol . 39 (1): 1–30. doi : 10.1002/jcp.1030390102 . PMID 14907815 .