Lektyny typu C - C-type lectin
Domena lektyny typu C | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||||
Symbol | Lektyna_C | ||||||||
Pfam | PF00059 | ||||||||
InterPro | IPR001304 | ||||||||
MĄDRY | WYBIERZ | ||||||||
PROSITE | PS50041 | ||||||||
SCOP2 | 2msb / zakres / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd00037 | ||||||||
Membrana | 52 | ||||||||
|
Typu C lektyny ( CLEC ) jest typu węglowodanów wiążącego domenę białka znanego jako lektyna . Oznaczenie typu C wynika z ich zapotrzebowania na wapń do wiązania. Białka zawierające domeny lektynowe typu C pełnią różnorodne funkcje, w tym adhezję komórkową, odpowiedź immunologiczną na patogeny i apoptozę .
Klasyfikacja
Drickamer i in. sklasyfikowano lektyny typu C na 7 podgrup (I do VII) w oparciu o kolejność różnych domen białkowych w każdym białku. Klasyfikacja ta została następnie zaktualizowana w 2002 roku, prowadząc do siedmiu dodatkowych grup (VIII do XIV). Ostatnio dodano trzy kolejne podgrupy (od XV do XVII).
Grupa | Nazwa | Powiązane domeny |
---|---|---|
ja | Lektykanie | Domeny EGF , Sushi , Ig i Link |
II | Azjaloglikoproteina i receptory DC | Żaden |
III | Kolektyny | Żaden |
IV | Selektyny | Domeny sushi i EGF |
V | NK - receptory komórkowe | Żaden |
VI | Receptory endocytarne multi-CTLD | Domeny FnII i rycyny |
VII | Grupa rejestracyjna | Żaden |
VIII | Chondrolektyna , Layilin | Żaden |
IX | Tetranektyna | Żaden |
X | Policystyna | Domeny WSC, REJ, PKD |
XI | Przyciąganie ( ATRN ) | Domeny PSI, EGF i CUB |
XII | Główne białko zasadowe eozynofili (EMBP) | Żaden |
XIII | DGCR2 | Żaden |
XIV | trombomodulina , CD93 , CD248 , CLEC14A | Domeny EFG |
XV | Bimlec | Żaden |
XVI | SEEC | Domeny SCP i EGF |
XVII | CBCP/ Frem1 /QBRICK | Powtórzenia CSPG i domeny CalX-beta |
CLECs obejmują:
- CLEC1A , CLEC1B
- CLEC2A , CLEC2B , CD69 (CLEC2C), CLEC2D , CLEC2L
- CLEC3A , CLEC3B
- CLEC4A , CLEC4C , CLEC4D , CLEC4E , CLEC4F , CLEC4G , ASGR1 (CLEC4H1), ASGR2 (CLEC4H2), FCER2 (CLEC4J), CD207 (CLEC4K), CD209 (CLEC4L), CLEC4M
- CLEC5A
- CLEC6A
- CLEC7A
- OLR1 (CLEC8A)
- CLEC9A
- CLEC10A
- CLEC11A
- CLEC12A , CLEC12B
- CD302 (CLEC13A) LY75 (CLEC13B) PLA2R1 (CLEC13C) MRC1 (CLEC13D) MRC2 (CLEC13E)
- CLEC14A
- CLEC16A
- CLEC17A
„Receptory lektynopodobne komórek NK” są bardzo blisko spokrewnioną grupą:
- KLRA1
- KLRB1 (CLEC5B)
- KLRC1 , KLRC2 , KLRC3 , KLRC4
- KLRD1
- KLRF1 (CLEC5C)
- KLRG1 (CLEC15A), KLRG2 (CLEC15B)
- KLRK1
Dodatkowe białka zawierające tę domenę obejmują:
- AGC1 ; ATRNL1
- BCAN
- CD248 ; CD72 ; CD93 ; CHODL ; CL-K1-la ; CL-K1-Ib ; CL-K1-Ic ; CLECSF5 ; KOLEC10 ; KOLEC11 ; KOLEC12 ; CSPG3
- FCER2 ; FREM1 ; HBXBP ;
- ŁAŃ ; LOC348174 ; LOC728276
- MAFA ; MBL2 ; MGC34761 ; MICL ; MRC1L1
- OLR1
- PAP ; PKD1 ; PKD1L2 ; PLA2R1 ; PRG2 ; PRG3
- REG1A ; REG1B ; REG3A ; REG3G ; REG4
- WYBÓR ; SPRZEDAJ ; SELP ; SFTPA1 ; SFTPA2 ; SFTPA2B ; SFTPD ; SRCL
- THBD
- VCAN
Bibliografia
Linki zewnętrzne
- Functional Glycomics Gateway , współpraca między Consortium for Functional Glycomics a Nature Publishing Group