Kafeteria roenbergensis -Cafeteria roenbergensis
| Kafeteria roenbergensis | |
|---|---|
|
|
Klasyfikacja naukowa 
|
|
| Klad : | SAR |
| Gromada: | Bigyra |
| Klasa: | Bicosoecophyceae |
| Zamówienie: | Bicosoecales |
| Rodzina: | Cafeteriaceae |
| Rodzaj: |
Kafeteria Fenchel & Patterson, 1988 |
| Gatunek: |
C. roenbergensis
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Kafeteria roenbergensis Fenchel i Patterson, 1988
|
|
Cafeteria roenbergensis jest małym bakteriożernym wiciowcem morskim. Został odkryty przez duńskiego ekologa morskiego Toma Fenchela i nazwany przez niego i taksonomę Davida J. Pattersona w 1988 roku. Należy do jednego z trzech rodzajów bicosoecids i jest pierwszym odkrytym z dwóch znanychgatunków kafeterii . Bicosoecids należą do szerokiej grupy, stramenopiles, która obejmuje okrzemki, brunatne i złote algi znane pod wspólną nazwą Heterokonta , pierwotniaki, takie jak opalinidy i aktynofrydy heliozoa oraz grzyby oomycete. Gatunek ten występuje głównie w wodach przybrzeżnych, gdzie występuje wysokie stężenie bakterii, na których się żywi. Jego żarłoczny apetyt odgrywa znaczącą rolę w regulacji populacji bakterii.
Fizjologia
Cafeteria roenbergensis to lekko spłaszczony bisoecid w kształcie nerki . Jego komórka zwykle mierzy od 3 do 10 μm i ma objętość około 20 μm³. Jest bezbarwny i ma dwie nierównej wielkości wici. Gładka wić, ustawiona pod kątem do tyłu, jest krótsza i przyczepia się do podłoża w nieruchliwych komórkach, ale za sobą ciągnie się w komórkach ruchliwych . Owłosiona wić jest skierowana do przodu łukiem w bezszypułkowych komórkach. Kafeteria jest organizmem eukariotycznym , zawiera więc typowe organelle, takie jak mitochondria i jądra komórkowe .
Cafeteria roenbergensis rozmnaża się bezpłciowo poprzez rozszczepienie binarne , najpierw replikując wici i organelle wewnętrzne przed podziałem komórki. Dla tego gatunku nie jest znana aktywność seksualna. Komórki mogą się replikować w mniej niż 10 godzin.
Zachowanie
Cafeteria roenbergensis jest podajnikiem zawiesinowym, co oznacza, że żywi się poprzez filtrowanie zawieszonych bakterii, głównego źródła pożywienia i innych cząstek stałych z wody. Jego dwie wici ułatwiają karmienie, poruszanie się i przyczepienie do podłoża. Wić przednia odpowiada za poruszanie się i odżywianie. Wprawia komórkę w szybki ruch spiralny. Podczas karmienia bije około 40 razy na sekundę, tworząc strumień wody, który porusza się około 100 mikrometrów na sekundę. Ten prąd przenosi bakterie do aparatów gębowych. Pokarm jest spożywany poniżej podstawy wici, która jest określana jako strona brzuszna. W nieruchliwych komórkach C. roenbergensis (komórkach, które wolą zakotwiczyć się w podłożu) tylna wić pomaga przymocować organizm do podłoża podczas karmienia. Wici są zakotwiczone wstążkami „korzeniowymi” i linami subkomórkowymi. Działają jak szkielet, a także wspierają obszar ust.
Ekologia
Bakterieżerne nanowicice, ogólna grupa, do której należy C. roenbergensis , stanowią znaczną część zbiorowisk pierwotniaków oceanicznych , a także tych w wodach słodkich, glebach i innych siedliskach. Mówi się, że są głównym konsumentem bakterii w wielu siedliskach, kontrolując populacje bakterii podczas „pasania”.
Siedlisko
Kafeteria roenbergensis została znaleziona we wszystkich badanych oceanach, ale jest szczególnie powszechna w wodach przybrzeżnych. Te protisty występują w biosferze znanej jako „zespoły mikrobiologiczne”. Oznacza to, że są one obecne w tak małych ilościach, że nie są łatwe do wykrycia i można je odzyskać i wyizolować jedynie przy użyciu specjalistycznych technik izolacji, takich jak cytometria przepływowa . Ishigaki i sanie (2001) stwierdzili, że C roenbergensis przestał rozmnażać, gdy stężenie bakterii, które zostały wypasu się mniej niż 2,0 x 10 7 komórek ml -1 . Inne wiciowce były zdolne do namnażania się w stężeniach znacznie niższe bakterii, co oznacza, że stężenie bakterii jest czynnikiem ograniczającym w Cafeteria . Wiciowce mają różne zdolności gromadzenia bakterii do ust za pomocą wici, a to badanie sugeruje, że zdolności gatunków Kafeterii mogą być gorsze niż innych wiciowców, ponieważ Kafeteria jest zwykle specyficzna dla nisz o wysokim stężeniu bakterii.
Wirus
Ogromny wirus, wirus Cafeteria roenbergensis (CroV) infekuje i powoduje lizę C. roenbergensis . Wpływ CroV na naturalne populacje C. roenbergensis pozostaje nieznany; Stwierdzono jednak, że wirus jest bardzo specyficzny dla gospodarza i nie infekuje innych blisko spokrewnionych organizmów. Cafeteria roenbergensis jest również zarażona drugim wirusem, wirusofagiem Mavirus , który jest zdolny do replikacji tylko w obecności CroV. Wirus ten zakłóca replikację CroV, co prowadzi do przeżycia komórek C. roenbergensis . Mawirus jest zdolny do integracji z genomem komórek C. roenbergensis , a tym samym do nadawania odporności populacji
Taksonomia
Kafeteria jest sklasyfikowana w grupie o nazwie „ Grupa heterotroficzna ”. Ma jeszcze jeden znany gatunek w swoim rodzaju, Cafeteria minuta , który został znaleziony w tropikalnych osadach morskich przez Larsena i Pattersona w 1990 roku.
Nazwa
Biologowi morskiemu Tomowi Fenchelowi, jednemu z dwóch autorytetów gatunkowych, który jako pierwszy opisał C. roenbergensis , przypisuje się żartowanie na temat nazwy chromalweolanu: „Znaleźliśmy nowy gatunek orzęsek podczas morskiego pola w Rønbjerg i nazwaliśmy go Cafeteria roenbergensis z powodu jego żarłoczny i niewybredny apetyt po wielu dyskusjach przy kolacji w lokalnej stołówce”. —Tom Fenchel
Genom mitochondrialny
Cafeteria roenbergensis jest wyjątkowa wśród eukariontów, ponieważ ma bardzo zwarty genom mitochondrialny, który zawiera mniej niż 3,4% intronów . Niektóre źródła utrzymują, że jego genom mitochondrialny w ogóle nie zawiera intronów. Kod translacji mitochondriów w C. roenbergensis nie jest standardowy w porównaniu z jego najbliższymi znanymi krewnymi, Phytophthora infestans i Ochromonas danica . Zamiast działać jako kodon stop , w kawiarni UGA koduje tryptofan .
Kultura
Ponieważ łatwo je hodować w kulturze , Cafeteria roenbergensis została poddana wielu bardziej szczegółowym badaniom, takim jak badania genomiczne i ekologiczne, które wykazały, że gatunek ten ma najbardziej funkcjonalnie zwarte DNA wśród eukariontów. W kulturze Kafeteria jest karmiona bakteriami Vibrio . W teście przeprowadzonym przez Park i Simpson w 2010 r. stwierdzono, że komórki Kafeterii najlepiej rosną przy zasoleniu od 3 ppm do 100 ppm, ale nie mogą przetrwać w wyższych stężeniach.