Model tRNA koniczyny - Cloverleaf model of tRNA
Modelu koniczyny tRNA jest modelem, który przedstawia strukturę cząsteczkową tRNA . Model ujawnił, że łańcuch tRNA składa się z dwóch końców - czasami nazywanych „końcami biznesowymi” - i trzech ramion. Dwa z ramion mają pętlę, pętlę D (pętla dihydro U) i pętlę Tψc z miejscem rozpoznawania rybosomu . Trzecie ramię, znane jako „zmienne ramię”, ma trzpień z opcjonalną pętlą. Jeden koniec łańcuchów (o strukturze dwuniciowej, w której końce 5 'i 3' sąsiadują ze sobą), łodyga akceptora aminokwasów, zwykle łączy się z aminokwasami i takie reakcje są często katalizowane przez określone enzymy, aminoacyl syntetaza tRNA . Na przykład, jeśli aminokwasem, który przyłącza się na końcu jest alanina , reakcja będzie katalizowana przez syntazę alaniny-tRNA w celu wytworzenia tRNA phe .
Drugi koniec - spód często nazywany „ramieniem DNA” - składa się z sekwencji trzech zasad, które tworzą parę z komplementarną sekwencją zasad w mRNA .