Syntaza metioniny - Methionine synthase

MTR
PBB Protein MTR image.jpg
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Identyfikatory
Skróty MTR , HMAG, MS, cblG, metylotransferaza 5-metylotetrahydrofolianu-homocysteiny
Identyfikatory zewnętrzne OMIM : 156570 MGI : 894292 HomoloGene : 37280 Karty genetyczne : MTR
Numer WE 2.1.1.13
Ortologi
Gatunek Człowiek Mysz
Entrez
Zespół
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_000254
NM_001291939
NM_001291940

NM_001081128

RefSeq (białko)

NP_000245
NP_001278868
NP_001278869

NP_001074597

Lokalizacja (UCSC) Chr 1: 236,8 – 236,92 Mb Chr 13: 12.18 – 12.26 Mb
Wyszukiwanie w PubMed
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Syntaza metioniny znana również jako MS , MeSe , MTR odpowiada za regenerację metioniny z homocysteiny . U ludzi jest kodowany przez gen MTR (metylotransferaza 5-metylotetrahydrofoliano-homocysteiny). Syntaza metioniny jest częścią cyklu biosyntezy i regeneracji S-adenozylometioniny (SAMe) . U zwierząt enzym ten wymaga witaminy B12 (kobalaminy) jako kofaktora , podczas gdy forma występująca w roślinach jest niezależna od kobalaminy. Mikroorganizmy wyrażają zarówno formy zależne od kobalaminy, jak i niezależne od kobalaminy.

Mechanizm

Reakcja katalizowana przez syntazę metioniny (kliknij, aby powiększyć)

Syntaza metioniny katalizuje ostatni etap regeneracji metioniny (Met) z homocysteiny (Hcy). Cała reakcja przekształca 5-metylotetrahydrofolian (N 5- MeTHF) w tetrahydrofolian (THF), jednocześnie przenosząc grupę metylową do homocysteiny z wytworzeniem metioniny. Metionina jest jedynym syntazy ssaczy enzym, który metabolizuje N 5 -MeTHF regenerację aktywnego kofaktora THF. W formach enzymu zależnych od kobalaminy reakcja przebiega w dwóch etapach w reakcji ping-ponga. Enzym wstępnie zagruntowane w reaktywnej przez przeniesienie grupy metylowej z N 5 -MeTHF do CO (i) enzym związany kobalaminy (COB), tworząc metylo-kobalaminy (Me-cob), który zawiera teraz Me-Co (III) i aktywacja enzymu. Następnie Hcy, który skoordynował się ze związanym z enzymem cynkiem, tworząc reaktywny tiolan, reaguje z Me-Cob. Aktywowana grupa metylowa jest przenoszona z Me-Cob do tiolanu Hcy, który regeneruje Co(I) w kolbie, a Met jest uwalniany z enzymu. Mechanizm kolby niezależne ma taką samą ogólną drogę ale z bezpośrednią reakcję pomiędzy tiolanu cynku i N 5 -MeTHF.

Ścieżka zmiatania reduktazy syntazy metioniny w celu odzyskania inaktywowanej syntazy metioniny

Mechanizm działania enzymu zależy od ciągłej regeneracji Co(I) w kolbie, ale nie zawsze jest to gwarantowane. Zamiast tego, co 1–2000 katalitycznych obrotów, Co(I) może zostać utleniony do Co(II), co spowoduje trwałe zatrzymanie aktywności katalitycznej. Oddzielne białko, reduktaza syntazy metioniny , katalizuje regenerację Co(I) i przywrócenie aktywności enzymatycznej. Ponieważ utlenianie kolb-Co(I) nieuchronnie wyłącza zależną od kolb aktywność syntazy metioninowej, defekty lub niedobory reduktazy syntazy metioninowej są powiązane z niektórymi chorobami związanymi z niedoborem syntazy metioninowej omówionych poniżej. Te dwa enzymy tworzą sieć zmiataczy widoczną w lewym dolnym rogu.

Struktura

Domena wiążąca homocysteinę w syntazie metioniny. His 618, Cys 620 i Cys704 wiążą Zn (fioletowy), który wiąże się z homocysteiną (czerwony)

Rozwiązano struktury krystaliczne zarówno dla MetH niezależnego od kolb, jak i zależnego od kolb MetH, z niewielkim podobieństwem w ogólnej strukturze, pomimo identycznej reakcji netto przeprowadzanej przez każdy z nich i podobieństw w obrębie miejsc wiązania, takich jak miejsce wiązania Hcy. Kolby zależne met jest podzielona na 4 odrębnych domen: Aktywacja, wiążących kobalaminę (domena cob) , homocysteiny wiążące (Hcy domen) i N 5 -methylTHF wiązania (domena MeTHF). Domena aktywacyjna jest miejscem interakcji z reduktazą syntazy metioninowej i wiąże SAM, która jest wykorzystywana jako część cyklu reaktywacji enzymu. Domena Cob zawiera Cob umieszczony pomiędzy kilkoma dużymi alfa helisami i związany z enzymem, tak że atom kobaltu grupy jest wystawiony na kontakt z innymi domenami. Domena Hcy zawiera krytyczne miejsce wiązania cynku, składające się z reszt cysteiny lub histydyny skoordynowanych z jonem cynku, który może wiązać Hcy, z przykładem MetH niezależnego od Cob pokazanym po prawej stronie. N 5 -MeTHF domena wiążąca zawiera konserwowany lufy, w którym n 5 wiązań wodorowych -MeTHF puszki z asparaginą , argininą i kwasu asparaginowego pozostałości. Cała struktura przechodzi dramatyczny ruch wahadłowy podczas katalizy, gdy domena Cob przemieszcza się tam iz powrotem z domeny Hcy do domeny Fol, przenosząc aktywną grupę metylową z domeny Fol do domeny Hcy.

Funkcjonować

Syntaza metioniny to enzym 4

Głównym celem syntazy metioniny jest regeneracja Met w cyklu S-adenozylometioniny, która w jednym obrocie zużywa Met i ATP oraz generuje Hcy. Cykl ten jest krytyczny, ponieważ S-adenozylometionina jest szeroko stosowana w biologii jako źródło aktywnej grupy metylowej, a zatem syntaza metioniny pełni podstawową funkcję, pozwalając na utrwalenie cyklu SAM bez stałego dopływu Met. W ten sposób, metionina syntazy służy również do utrzymania niskiego poziomu Hcy a ponieważ metionina syntazy jeden z kilku enzymów stosowanych N 5 -MeTHF jako podłoże do pośredniego utrzymywania poziomu THF.

W roślinach i mikroorganizmach syntaza metioniny służy podwójnemu celowi, zarówno utrwalania cyklu SAM, jak i katalizowania końcowego etapu syntezy w syntezie Met de novo . Chociaż reakcja jest dokładnie taka sama dla obu procesów, ogólna funkcja jest różna od syntazy metioniny u ludzi, ponieważ Met jest niezbędnym aminokwasem, który nie jest syntetyzowany de novo w organizmie.

Znaczenie kliniczne

Mutacje w genie MTR zostały zidentyfikowane jako podstawowa przyczyna niedoboru metylokobalaminy grupy G lub niedoboru metylokobalaminy typu cblG. Niedobór lub deregulacja enzymu z powodu niedoboru reduktazy syntazy metioninowej może bezpośrednio skutkować podwyższonym poziomem homocysteiny ( hiperhomocysteinemią ), co wiąże się ze ślepotą, objawami neurologicznymi i wadami wrodzonymi. Większość przypadków niedoboru syntazy metioniny objawia się w ciągu 2 lat od urodzenia, au wielu pacjentów szybko rozwija się ciężka encefalopatia. Jedną z konsekwencji zmniejszonej aktywności syntazy metioniny, którą można zmierzyć rutynowymi klinicznymi badaniami krwi, jest niedokrwistość megaloblastyczna .

Genetyka

Zidentyfikowano kilka polimorfizmów w genie MTR.

  • 2756D→G (Asp 919 Gly)

Zobacz też

Bibliografia

Dalsza lektura

Zewnętrzne linki