Domena wiążąca fosfotyrozynę - Phosphotyrosine-binding domain
Domena wiążąca fosfotyrozynę | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||||||
Symbol | PTB | ||||||||||
Pfam | PF08416 | ||||||||||
InterPro | IPR013625 | ||||||||||
CDD | cd00934 | ||||||||||
|
Domena PTB (typ IRS-1) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||||
Symbol | IRS | ||||||||
Pfam | PF02174 | ||||||||
InterPro | IPR002404 | ||||||||
MĄDRY | PTBI | ||||||||
SCOP2 | 1cli / zakres / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd01204 | ||||||||
|
W biologii molekularnej, domeny fosfotyrozyny wiążące są domen białkowych , które wiążą się fosfotyrozyna .
Domena wiążąca fosfotyrozynę (PTB, również domena oddziaływania fosfotyrozyny lub domena PI) w tensynie białkowej ma tendencję do znajdowania się na C-końcu . Tensyna jest wielodomenowym białkiem, które wiąże się z filamentami aktynowymi i działa jako cząsteczka ogniskowo-adhezyjnej (adhezja ogniskowa to obszary błony komórkowej, przez które komórki przyłączają się do macierzy zewnątrzkomórkowej). Tensyna ludzka posiada miejsca wiążące aktynę , domenę SH2 ( Pfam PF00017 ) i region podobny do supresora nowotworu PTEN . Domena PTB oddziałuje z ogonami cytoplazmatycznymi beta integryny poprzez wiązanie z motywem NPXY.
Domena wiążąca fosfotyrozynę substratu 1 receptora insuliny nie jest związana z domeną wiążącą fosfotyrozynę tensyny. Białka substratu 1 receptora insuliny zawierają zarówno domenę homologiczną plekstryny, jak i domenę wiążącą fosfotyrozynę (PTB). PTB domeny ułatwiają interakcję z aktywowanym tyrozynowej - fosforylacji receptora insuliny . Domena PTB jest usytuowana w kierunku N-końca . Dwie argininy w tej domenie są odpowiedzialne za wiązanie wodorowe reszt fosfotyrozyny na peptydzie Ac- LYASSNPAPY- NH2 w obszarze przybłonowym receptora insuliny. Dalsze oddziaływania poprzez „zmostkowane” cząsteczki wody są koordynowane przez reszty Asn i Ser. Domena PTB ma zwartą, 7-niciową strukturę beta-kanapki , zakończoną C-końcową helisą . Peptyd substratu pasuje do szczeliny w kształcie litery L utworzonej z C-końcowej helisy i nici 5 i 6.
Białka ludzkie zawierające te domeny
APBA1 ; APBA2 ; APBA3 ; APPL1 ; EPS8 ; EPS8L1 ; EPS8L2 ; EPS8L3 ; TENC1 ; TNS ; TNS1 ; TNS3 ; TNS4 ; DOK1 ; DOK2 ; DOK3 ; DOK4 ; DOK5 ; DOK6 ; DOK7 ; FRS2 ; FRS3 ; IRS1 ; IRS2 ; IRS4 ; NOS1AP ; TLN1 ; TLN2
Zobacz też
- Domeny SH2 również wiążą fosforylowane tyrozyny
Bibliografia
Linki zewnętrzne
- Eukariotyczny motyw liniowy, klasa motywu zasobów LIG_PTB_Phospho_1