Domena wiążąca fosfotyrozynę - Phosphotyrosine-binding domain

Domena wiążąca fosfotyrozynę
PDB 1wvh EBI.jpg
Struktura domeny PTB tensyny1.
Identyfikatory
Symbol PTB
Pfam PF08416
InterPro IPR013625
CDD cd00934
Domena PTB (typ IRS-1)
PDB 1irs EBI.jpg
irs-1 domena ptb skompleksowana z fosfopeptydem receptora il-4, NMR, minimalna średnia struktura
Identyfikatory
Symbol IRS
Pfam PF02174
InterPro IPR002404
MĄDRY PTBI
SCOP2 1cli / zakres / SUPFAM
CDD cd01204

W biologii molekularnej, domeny fosfotyrozyny wiążącedomen białkowych , które wiążą się fosfotyrozyna .

Domena wiążąca fosfotyrozynę (PTB, również domena oddziaływania fosfotyrozyny lub domena PI) w tensynie białkowej ma tendencję do znajdowania się na C-końcu . Tensyna jest wielodomenowym białkiem, które wiąże się z filamentami aktynowymi i działa jako cząsteczka ogniskowo-adhezyjnej (adhezja ogniskowa to obszary błony komórkowej, przez które komórki przyłączają się do macierzy zewnątrzkomórkowej). Tensyna ludzka posiada miejsca wiążące aktynę , domenę SH2 ( Pfam PF00017 ) i region podobny do supresora nowotworu PTEN . Domena PTB oddziałuje z ogonami cytoplazmatycznymi beta integryny poprzez wiązanie z motywem NPXY.

Domena wiążąca fosfotyrozynę substratu 1 receptora insuliny nie jest związana z domeną wiążącą fosfotyrozynę tensyny. Białka substratu 1 receptora insuliny zawierają zarówno domenę homologiczną plekstryny, jak i domenę wiążącą fosfotyrozynę (PTB). PTB domeny ułatwiają interakcję z aktywowanym tyrozynowej - fosforylacji receptora insuliny . Domena PTB jest usytuowana w kierunku N-końca . Dwie argininy w tej domenie są odpowiedzialne za wiązanie wodorowe reszt fosfotyrozyny na peptydzie Ac- LYASSNPAPY- NH2 w obszarze przybłonowym receptora insuliny. Dalsze oddziaływania poprzez „zmostkowane” cząsteczki wody są koordynowane przez reszty Asn i Ser. Domena PTB ma zwartą, 7-niciową strukturę beta-kanapki , zakończoną C-końcową helisą . Peptyd substratu pasuje do szczeliny w kształcie litery L utworzonej z C-końcowej helisy i nici 5 i 6.

Białka ludzkie zawierające te domeny

APBA1 ; APBA2 ; APBA3 ; APPL1 ; EPS8 ; EPS8L1 ; EPS8L2 ; EPS8L3 ; TENC1 ; TNS ; TNS1 ; TNS3 ; TNS4 ; DOK1 ; DOK2 ; DOK3 ; DOK4 ; DOK5 ; DOK6 ; DOK7 ; FRS2 ; FRS3 ; IRS1 ; IRS2 ; IRS4 ; NOS1AP ; TLN1 ; TLN2

Zobacz też

  • Domeny SH2 również wiążą fosforylowane tyrozyny

Bibliografia

Linki zewnętrzne

Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR013625
Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR002404