współrzędnej reakcji - Reaction coordinate
W chemii , A współrzędnej reakcji jest streszczenie jednowymiarowy współrzędnych , który stanowi postęp wzdłuż ścieżki reakcji. Zwykle jest to, że zmienia się parametr geometryczny podczas konwersji jednego lub więcej jednostek molekularnych . W symulacji dynamiki molekularnej, reakcję nazywa współrzędnych zmienna zbiorowego .
Współrzędne te są czasami reprezentują prawdziwy układ współrzędnych (takich jak długość wiązania , pod kątem wiązania ...), chociaż w przypadku bardziej złożonych reakcji w szczególności, może to być (i stosuje non parametry geometryczne, na przykład, trudno wiązania w ).
Współrzędne reakcji często wykreślono energii swobodnej wykazać w jakiejś postaci schematycznej potencjalna energia profilu (punkt przecięcia z powierzchni energii potencjalnej ) powiązanych z reakcji.
W publikacji w teorii stanu przejściowego współrzędnej reakcji jest to, że koordynuje się zestawu krzywoliniowych współrzędnych otrzymanych z konwencjonalnych dla reagentów, które na każdym etapie reakcji, płynne przejście od konfiguracji reagentów przez to na stan przejściowy w THE konfiguracja produktów . Współrzędnej reakcji jest zazwyczaj wybrany śledzić ścieżkę wzdłuż gradientu (ścieżka z najpłytszej wejścia / najgłębszej opadania) potencjalnej energii z reagentów produktów.
Na przykład, w homolytic dysocjacji cząsteczkowego wodoru , apt system wyboru byłoby współrzędnych odpowiada współrzędnych długości wiązania .