Lista RNA - List of RNAs

Kwas rybonukleinowy (RNA) występuje w różnych formach w organizmach i pełni wiele różnych ról. Poniżej wymieniono rodzaje RNA pogrupowane według ról. Wymieniono i wyjaśniono skróty dla różnych typów RNA.

Według roli

RNA zaangażowane w syntezę białek
Rodzaj Skr. Funkcjonować Dystrybucja Nr ref.
Komunikator RNA mRNA Kody białka Wszystkie organizmy
Rybosomalny RNA rRNA Tłumaczenie Wszystkie organizmy
RNA cząsteczki rozpoznającej sygnał 7SL RNA lub RNA SRP Integracja membrany Wszystkie organizmy
Przenieś RNA tRNA Tłumaczenie Wszystkie organizmy
Transfer-komunikator RNA tmRNA Ratowanie zatrzymanych rybosomów Bakteria
RNA zaangażowane w modyfikację potranskrypcyjną lub replikację DNA
Rodzaj Skr. Funkcjonować Dystrybucja Nr ref.
Małe jądrowe RNA snRNA Łączenie i inne funkcje Eukarionty i archeony
Mały jąderkowy RNA snoRNA Modyfikacja nukleotydowa RNA Eukarionty i archeony
SmY RNA SmY trans-splicing mRNA Nicienie
Małe RNA specyficzne dla ciała Cajala scarRNA Rodzaj snoRNA; Modyfikacja nukleotydowa RNA
Przewodnik RNA gRNA Modyfikacja nukleotydów mRNA Mitochondria kinetoplastyd
Rybonukleaza P RNaza P dojrzewanie tRNA Wszystkie organizmy
Rybonukleaza MRP RNaza MRP Dojrzewanie rRNA, replikacja DNA Eukarionty
Y RNA Przetwarzanie RNA, replikacja DNA Zwierząt
Składnik RNA telomerazy TERC Synteza telomerów Większość eukariontów
Spliced ​​Leader RNA SL RNA Trans-splicing mRNA, przetwarzanie RNA
RNA regulacyjne
Rodzaj Skr. Funkcjonować Dystrybucja Nr ref.
Antysensowne RNA aRNA, asRNA Atenuacja transkrypcyjna / degradacja mRNA / stabilizacja mRNA / blokada translacji Wszystkie organizmy
Naturalny transkrypt antysensowny cis cis-NAT Regulacja genów
CRISPR RNA crRNA Odporność na pasożyty poprzez celowanie w ich DNA Bakterie i archeony
Długi niekodujący RNA lncRNA Regulacja transkrypcji genów, regulacja epigenetyczna Eukarionty
MikroRNA miRNA Regulacja genów Większość eukariontów
RNA oddziałujące z Piwi piRNA Obrona transpozonowa, może inne funkcje Większość zwierząt
Mały interferujący RNA siRNA Regulacja genów Większość eukariontów
Krótkie spinki do włosów RNA shRNA Regulacja genów Większość eukariontów
Trans-działające siRNA tasiRNA Regulacja genów Rośliny lądowe
Powtórz powiązane siRNA rasiRNA rodzaj piRNA; obrona transpozonowa Drosophila
7SK RNA 7SK ujemnie regulujący kompleks CDK9/cyklina T
Wzmacniające RNA eRNA Regulacja genów
Pasożytnicze RNA
Rodzaj Funkcjonować Dystrybucja Nr ref.
Retrotranspozon Samorozmnażanie się Eukarionty i niektóre bakterie
Genom wirusa Nośnik informacji Dwuniciowego RNA wirusy , wirusy RNA o dodatniej poczucie , negatyw-sense wirusy RNA , wiele wirusów satelitarne i odwrotnych wirusów transkrypcji
Wiroid Samorozmnażanie się Zainfekowane rośliny
Satelitarny RNA Samorozmnażanie się Zainfekowane komórki
Inne RNA
Rodzaj Skr. Funkcjonować Dystrybucja Nr ref.
Krypta RNA vRNA, vtRNA Wydalenie ksenobiotyków (przypuszczalne)

Skróty RNA

Skr. Nazwa Rodzina Opis Nr ref.
ncRNA niekodujący RNA -
nmRNA niezwiązany z komunikatorami RNA - synonim ncRNA
sRNA małe RNA - synonim ncRNA
smnRNA małe nie-komunikacyjne RNA - synonim ncRNA
tRNA transfer RNA RF00005
sRNA rozpuszczalny RNA - synonim tRNA
mRNA posłańca RNA -
pcRNA białko kodujące RNA - synonim mRNA
rRNA rybosomalny RNA wiele rodzin
5S rRNA 5S rybosomalny RNA RF00001
5.8S rRNA 5.8S rybosomalny RNA RF00002
SSU rRNA mała podjednostka rybosomalnego RNA CL00111
LSU rRNA duża podjednostka rybosomalnego RNA CL00112
NoRC RNA RNA związane z kompleksem przebudowy jąder RF01518
pRNA promotor RNA RF01518 synonim NoRC RNA
6S RNA 6S RNA RF00013
SsrS RNA RF00013 synonim 6S RNA
aRNA antysensowne RNA - synonim asRNA
asRNA antysensowne RNA -
asmiRNA antysensowne mikroRNA -
cis-NAT cis-naturalny transkrypt antysensowny - Naturalne transkrypty antysensowne transkrybowane z tego samego locus genomowego, co ich cel, ale z przeciwnej nici DNA i tworzące idealne pary
crRNA CRISPR RNA -
tracrRNA trans-aktywujący crRNA -
CRISPR RNA CRISPR-Cas RNA wiele rodzin
DD RNA RNA odpowiedzi na uszkodzenie DNA - RNA, który aktywuje odpowiedź na uszkodzenia DNA
diRNA Małe RNA indukowane DSB -
dsRNA dwuniciowy RNA -
endo-siRNA endogenny mały interferujący RNA -
exRNA zewnątrzkomórkowy RNA -
gRNA przewodnik RNA -
hc-siRNA heterochromatyczny mały interferujący RNA -
hcsiRNA heterochromatyczny mały interferujący RNA - synonim hc-siRNA
hnRNA niejednorodny jądrowy RNA - synonim pre-mRNA (w ścisłym znaczeniu może obejmować transkrypty jądrowego RNA, które nie kończą się jako cytoplazmatyczne mRNA)
RNAi Interferencja RNA - Proces, w którym RNA hamuje ekspresję lub translację genów poprzez neutralizację docelowych cząsteczek mRNA
lincRNA długi międzygenowy niekodujący RNA -
lncRNA długi niekodujący RNA -
miRNA mikroRNA wiele rodzin
mrpRNA rybonukleaza przetwarzająca mitochondrialne RNA - synonim RNazy MRP
nat-siRNA naturalny antysensowny krótki interferujący RNA - synonim natsiRNA
natsiRNA naturalny antysensowny krótki interferujący RNA - Endogenne regulatory RNA, o długości od 21 do 24 nt, generowane z komplementarnych transkryptów mRNA, które są dalej przetwarzane w siRNA
OxyS RNA RNA odpowiedzi na stres oksydacyjny RF00035 Małe niekodujące RNA indukowane w odpowiedzi na stres oksydacyjny u Escherichia coli
piRNA RNA oddziałujące z piwi wiele rodzin Małe RNA, które tworzą kompleksy RNA-białko z białkami piwi w komórkach zwierzęcych
qiRNA Interferujący RNA QDE-2 -
rasiRNA Powtórz powiązane siRNA - Małe RNA biorące udział w szlaku interferencji RNA , rodzaj piRNA
RNaza MRP rybonukleaza przetwarzająca mitochondrialne RNA RF00030
RNaza P rybonukleaza P RF00010 Rodzaj rybonukleazy, która rozszczepia RNA
scarRNA małe RNA specyficzne dla ciała Cajala RF00553
scnRNA mały skan RNA -
scRNA małe cytoplazmatyczne RNA -
scRNA małe warunkowe RNA -
SgrS RNA sRNA związane z transportem cukru RF00534 Małe RNA aktywowane przez SgrR w Escherichia coli podczas stresu glukozowo-fosforanowego
shRNA krótkie RNA o strukturze spinki do włosów -
siRNA mały interferujący RNA -
SL RNA spliced ​​lider RNA wiele rodzin
SmY RNA trans-splicing mRNA RF01844 Małe jądrowe RNA znalezione w niektórych gatunkach nicieni, uważane za zaangażowane w trans-splicing mRNA
snoRNA małe jąderkowe RNA wiele rodzin
snRNA małe jądrowe RNA wiele rodzin
snRNP małe jądrowe białka rybonukleinowe -
SPA lncRNA 5' mały jąderkowy RNA z czapeczką i 3' poliadenylowany długi niekodujący RNA -
SRP RNA rozpoznawanie sygnału cząsteczki RNA CL00003
ssRNA jednoniciowy RNA -
stRNA mały czasowy RNA -
tasiRNA siRNA działające w trans -
tmRNA RNA przekaźnika transferowego RF00023 Bakteryjna cząsteczka RNA o podwójnych właściwościach podobnych do tRNA i informacyjnego RNA
uRNA U spliceosomalnego RNA wiele rodzin
vRNA skarbiec RNA - synonim vtRNA
vtRNA skarbiec RNA RF00006
Istniejący RNA Swoisty transkrypt nieaktywny wobec chromosomu X -
Y RNA Y RNA RF00019 Składniki cząsteczki rybonukleoproteinowej Ro60 i niezbędne do replikacji DNA poprzez interakcje z chromatyną i białkami inicjacyjnymi
NAT naturalne transkrypty antysensowne - Naturalne transkrypty antysensowne zakodowane w komórce, które wykazują komplementarność transkryptów z innymi transkryptami RNA
pre-mRNA prekursorowe RNA informacyjne - Niedojrzała pojedyncza nić informacyjnego RNA
circRNA okrągły RNA -
msRNA wielokopiowe, jednoniciowe RNA - Składnik retronów
cfRNA bezkomórkowy RNA -

Zobacz też

Bibliografia

Zewnętrzne linki