Oligopeptyd - Oligopeptide

Tripeptyd (przykład Val - Gly - Ala ) z końcem aminowym oznaczonym na
zielono ( L-Walina ) i końcem karboksylowym oznaczonym na niebiesko ( L-Alanina )
Tetrapeptyd (przykład Val - Gly - Ser - Ala ) z
zielonej oznaczone aminowego końca ( L-walina ) oraz
błękit wyraźny końcu karboksylowym ( L-alaniny )

Oligopeptyd , często nazywany po prostu peptyd ( oligo- , „kilka”), składa się z dwóch do dwudziestu aminokwasów i może zawierać dipeptydy , tripeptydy , tetrapeptydy i pentapeptydy. Niektóre z głównych klas naturalnie występujące oligopeptydy obejmują aeruginosins , cyanopeptolins , mikrocystyn , microviridins , microginins , anabaenopeptins i cyclamides . Mikrocystyny ​​są najlepiej przebadane ze względu na ich potencjalny wpływ toksyczny w wodzie pitnej. Przegląd niektórych oligopeptydów wykazał, że największą klasą są cyjanopeptoliny (40,1%), a następnie mikrocystyny ​​(13,4%).

Produkcja

Klasy oligopeptydów są wytwarzane przez nierybosomalne syntazy peptydów (NRPS), z wyjątkiem cyklamidów i mikrowirydyn syntetyzowanych na szlakach rybosomalnych .

Przykłady

Przykłady oligopeptydów obejmują:

  • Amanityny - Cykliczne peptydy pobrane z karpoforów kilku różnych gatunków grzybów. Są silnymi inhibitorami polimeraz RNA u większości gatunków eukariotycznych, zapobiegają wytwarzaniu mRNA i syntezie białek. Te peptydy są ważne w badaniach transkrypcji. Alfa-amanityna jest główną toksyną z gatunku Amanita phalloides , trującą w przypadku spożycia przez ludzi lub zwierzęta.
  • Antipain - Oligopeptyd wytwarzany przez różne bakterie, który działa jako inhibitor proteazy .
  • Ceruletide – specyficzny dekapeptyd znajdujący się w skórze Hyla caerulea , australijskiej żaby drzewnej . Ceruletyd ma bardzo wiele wspólnego pod względem działania i składu z cholecystokininą . Pobudza wydzielanie żołądkowe, żółciowe i trzustkowe; i niektóre mięśnie gładkie . Jest stosowany do wywoływania zapalenia trzustki w eksperymentalnych modelach zwierzęcych.
  • Glutation - Tripeptyd pełniący wiele ról w komórkach. Koniuguje się z lekami, aby uczynić je bardziej rozpuszczalnymi do wydalania, jest kofaktorem niektórych enzymów, bierze udział w przegrupowaniu wiązań dwusiarczkowych białek i redukuje nadtlenki.
  • Leupeptyny - Grupa acylowanych oligopeptydów wytwarzanych przez Actinomycetes, które działają jako inhibitory proteazy. Wiadomo , że hamują one w różnym stopniu trypsynę , plazminę , kalikreiny , papainę i katepsyny .
  • Netropsin - Podstawowy oligopeptyd wyizolowany ze Streptomyces netropsis . Jest cytotoksyczny, a jego silne, specyficzne wiązanie z obszarami AT DNA jest przydatne w badaniach genetycznych.
  • Pepstatyny – N - acylowane oligopeptydy wyizolowane z przesączów kultur Actinomycetes, które działają specyficznie hamując proteazy kwasowe, takie jak pepsyna i renina.
  • Peptyd T - N -( N -( N (2)-( N -( N -( N -( N - D -Alanylo L -serylo) - L -treonyl) - L - treonyl ) L - treonyl ) - L - asparaginyl) -L- tyrozylo) L- treonina. Homologia sekwencji dzielącej oktapeptyd z białkiem otoczki HIV gp120. Może być przydatny jako środek przeciwwirusowy w terapii AIDS. Sekwencja pentapeptydu rdzeniowego, TTNYT, składająca się z aminokwasów 4-8 w peptydzie T, jest sekwencją otoczki HIV wymaganą do przyłączenia do receptora CD4.
  • Phalloidin - Bardzo toksyczny polipeptyd wyizolowany głównie z Amanita phalloides (Agaricaceae) lub kapusty śmierci; powoduje śmiertelne uszkodzenie wątroby, nerek i ośrodkowego układu nerwowego w zatruciu grzybami; stosowany w badaniu uszkodzeń wątroby.
  • Teprotide - wytworzony przez człowieka nonapeptyd (Pyr-Trp-Pro-Arg-Pro-Gln-Ile-Pro-Pro), który jest dokładnie taki sam jak peptyd z jadu węża Bothrops jararaca. Hamuje kininazę II i ANGIOTENSYNĘ I i został zaproponowany jako środek przeciwnadciśnieniowy.
  • Tuftsyna - N (2) - ((1- ( N- (2) - L -Threonyl) - L -lizylo) - L prolilo) - L -argininą. Tetrapeptyd wytwarzany w śledzionie przez enzymatyczne rozszczepienie leukofilnej gamma-globuliny. W szczególności stymuluje aktywność fagocytarną leukocytów wielojądrzastych krwi i neutrofili. Peptyd znajduje się we fragmencie Fd cząsteczki gamma-globuliny.

Zobacz też

Bibliografia

Zewnętrzne linki