Skoncentrowany na genach pogląd na ewolucję - Gene-centered view of evolution

Z genu określa się jako „nie tylko jeden pojedynczym fizycznym kawałka DNA [ale] wszystkie repliki konkretnego kawałka DNA dystrybuowane na całym świecie”, to widok gen skoncentrowane ewolucji , oka widok genu , teorii selekcji genów , albo teorii samolubnego genu utrzymuje, że ewolucja adaptacyjna zachodzi poprzez zróżnicowane przeżycie konkurujących genów , zwiększając częstotliwość alleli tych alleli, których cechy fenotypowe skutecznie promują ich własne rozmnażanie. Zwolennicy tego punktu widzenia argumentują, że ponieważ informacje dziedziczne są przekazywane z pokolenia na pokolenie prawie wyłącznie przez DNA , dobór naturalny i ewolucję najlepiej rozpatrywać z perspektywy genów.

Zwolennicy punktu widzenia skoncentrowanego na genach argumentują, że pozwala on na zrozumienie różnych zjawisk, takich jak altruizm i konflikt wewnątrzgenomiczny , które w inny sposób trudno wyjaśnić z punktu widzenia skoncentrowanego na organizmie.

Skoncentrowany na genach pogląd na ewolucję jest syntezą teorii ewolucji poprzez dobór naturalny, teorii dziedziczenia cząstkowego i braku przekazywania cech nabytych . Stwierdza, że ​​te allele, których efekty fenotypowe skutecznie promują własne rozmnażanie, zostaną korzystnie wybrane w stosunku do alleli konkurencyjnych w populacji. Proces ten prowadzi do adaptacji z korzyścią dla alleli , które promują sukces reprodukcyjny organizmu lub innych organizmów zawierających ten sam allel ( altruizm pokrewny i efekt zielonej brody ) , a nawet własne rozmnażanie w stosunku do innych genów w tym samym organizmie . ( samolubne geny i konflikt wewnątrzgenomowy).

Przegląd

John Maynard Smith
Richard dawkins

Skoncentrowany na genach pogląd na ewolucję jest modelem ewolucji cech społecznych, takich jak egoizm i altruizm.

Nabyte cechy

Sformułowanie centralnego dogmatu biologii molekularnej podsumował Maynard Smith :

Jeśli centralny dogmat jest prawdziwy i jeśli prawdą jest również, że kwasy nukleinowe są jedynym sposobem przekazywania informacji między pokoleniami, ma to decydujące implikacje dla ewolucji. Sugerowałoby to, że każda ewolucyjna nowość wymaga zmian w kwasach nukleinowych i że te zmiany – mutacje – mają zasadniczo charakter przypadkowy i nieadaptacyjny. Zmiany w innych miejscach – w cytoplazmie jaja, w materiałach przenoszonych przez łożysko, w mleku matki – mogą zmienić rozwój dziecka, ale gdyby zmiany nie dotyczyły kwasów nukleinowych, nie miałyby długotrwałych skutków ewolucyjnych.

—  Maynard Smith

Odrzucenie spadku nabytych znaków, w połączeniu z Ronald Fisher statystyk , dając pacjentowi matematycznego oparcie i pokazując, jak Mendla genetyka była zgodna z doboru naturalnego w jego 1930 książce sensie genetycznym Teoria doboru naturalnego . JBS Haldane i Sewall Wright utorowali drogę do sformułowania teorii egoistycznego genu. W przypadku przypadków, w których środowisko może wpływać na dziedziczność, patrz epigenetyka .

Gen jako jednostka selekcji

Pogląd na gen jako jednostkę selekcji rozwinął się głównie w pracach Richarda Dawkinsa , WD Hamiltona , Colina Pittendrigha i George'a C. Williamsa . Został spopularyzowany i rozwinięty głównie przez Dawkinsa w jego książce Samolubny gen (1976).

Według książki Williamsa z 1966 r. Adaptacja i dobór naturalny ,

Istotą genetycznej teorii doboru naturalnego jest błąd statystyczny we względnych wskaźnikach przeżycia alternatyw (genów, osobników itp.). Skuteczność takiego nastawienia w wytwarzaniu adaptacji jest uzależniona od zachowania pewnych relacji ilościowych między czynnikami operacyjnymi. Jednym z koniecznych warunków jest to, aby wybrana jednostka miała wysoki stopień trwałości i niski wskaźnik zmian endogenicznych w stosunku do stopnia błędu systematycznego (różnice we współczynnikach selekcji).

—  Williams, 1966, s. 22–23

Williams argumentował, że „dobór naturalny fenotypów sam w sobie nie może wywołać skumulowanych zmian, ponieważ fenotypy są skrajnie przejściowymi przejawami”. Każdy fenotyp jest unikalnym produktem interakcji między genomem a środowiskiem. Nie ma znaczenia, jak sprawny i płodny jest fenotyp, w końcu zostanie zniszczony i nigdy nie zostanie zduplikowany.

Od 1954 r. wiadomo, że DNA jest głównym fizycznym podłożem informacji genetycznej i jest zdolne do replikacji z wysoką wiernością przez wiele pokoleń. Tak więc określony gen kodowany w sekwencji nukleozasad z linii replikowanych cząsteczek DNA może mieć wysoką trwałość i niski wskaźnik zmian endogennych.

W normalnym rozmnażaniu płciowym cały genom jest unikalną kombinacją chromosomów ojca i matki, wytworzoną w momencie zapłodnienia. Na ogół jest niszczona wraz ze swoim organizmem, ponieważ „ mejoza i rekombinacja niszczą genotypy równie pewnie jak śmierć”. Tylko połowa z nich jest przekazywana każdemu potomkowi w wyniku niezależnej segregacji .

A wysokie rozpowszechnienie horyzontalnego transferu genów u bakterii i archeonów oznacza, że ​​kombinacje genomowe tych bezpłciowo rozmnażających się grup są również przejściowe w czasie ewolucyjnym: „Tradycyjny pogląd, że ewolucję prokariotyczną można rozumieć przede wszystkim w kategoriach rozbieżności klonalnej i okresowej selekcji, musi zostać rozszerzonym, aby objąć wymianę genów jako siłę twórczą”.

Gen jako jednostka informacyjna utrzymuje się przez znaczący ewolucyjnie okres czasu poprzez linię wielu fizycznych kopii.

W swojej książce River out of Eden Dawkins ukuł wyrażenie funkcja użyteczności Boga, aby wyjaśnić swój pogląd na geny jako jednostki doboru. Używa tego wyrażenia jako synonimu „ sensu życia ” lub „celu życia”. Przez przeformułowanie słowo cel w zakresie tego, co ekonomiści nazywają się funkcję użytkową , czyli „to, co jest zmaksymalizowane”, próby Dawkins do inżynierii wstecznej cel w umyśle Boskim Inżyniera Natury, lub funkcji użyteczności boga . Wreszcie Dawkins twierdzi, że błędem jest zakładanie, że ekosystem lub gatunek jako całość istnieje w jakimś celu. Pisze on, że błędne jest również przypuszczenie, że poszczególne organizmy prowadzą sensowne życie; w naturze tylko geny pełnią funkcję użytkową – utrwalania własnego istnienia z obojętnością na wielkie cierpienia zadawane organizmom, które budują, eksploatują i odrzucają.

Organizmy jako nośniki

Geny są zwykle upakowane w genomie, który sam jest zawarty w organizmie. Geny grupują się w genomy, ponieważ „replikacja genetyczna wykorzystuje energię i substraty dostarczane przez gospodarkę metaboliczną w znacznie większych ilościach, niż byłoby to możliwe bez genetycznego podziału pracy”. Budują pojazdy, aby promować swoje wspólne interesy w skoku do następnej generacji pojazdów. Jak ujmuje to Dawkins, organizmy to „ maszyny przetrwania ” genów.

Efekt fenotypowy danego genu jest zależny od jego otoczenia, w tym od genów towarzyszących stanowiących z nim cały genom. Gen nigdy nie ma stałego efektu, więc jak można mówić o genie długich nóg? Wynika to z różnic fenotypowych między allelami. Można powiedzieć, że jeden allel, przy wszystkich innych rzeczach równych lub zmieniających się w pewnych granicach, powoduje większe odnóża niż jego alternatywa. Ta różnica umożliwia badanie doboru naturalnego.

„Gen może mieć wiele efektów fenotypowych, z których każdy może mieć wartość pozytywną, negatywną lub neutralną. To selektywna wartość netto efektu fenotypowego genu decyduje o losie genu”. Na przykład gen może sprawić, że jego nosiciel odniesie większy sukces reprodukcyjny w młodym wieku, ale także spowodować większe prawdopodobieństwo śmierci w późniejszym wieku. Jeśli korzyść przewyższa szkodę, uśrednioną dla jednostek i środowisk, w których występuje gen, wówczas fenotypy zawierające gen będą generalnie wybierane pozytywnie, a tym samym liczebność tego genu w populacji wzrośnie.

Mimo to konieczne staje się modelowanie genów w połączeniu z ich nośnikiem, jak również w połączeniu z otoczeniem pojazdu.

Samolubna teoria genów

Teorię doboru naturalnego z samolubnym genem można powtórzyć w następujący sposób:

Geny nie ukazują się nagie pod okiem doboru naturalnego, ale przedstawiają swoje efekty fenotypowe. [...] Różnice w genach powodują różnice w tych efektach fenotypowych. Dobór naturalny oddziałuje na różnice fenotypowe, a tym samym na geny. W ten sposób geny są reprezentowane w kolejnych pokoleniach proporcjonalnie do selektywnej wartości ich efektów fenotypowych.

—  Cronin, 1991, s. 60

Wynik jest taki, że „dominującymi genami w populacji płciowej muszą być te geny, które jako średni stan, poprzez dużą liczbę genotypów w dużej liczbie sytuacji, wywarły najkorzystniejszy efekt fenotypowy dla własnej replikacji”. Innymi słowy, oczekujemy samolubnych genów („samolubnych”, co oznacza, że ​​promują własne przetrwanie, niekoniecznie promując przetrwanie organizmu, grupy, a nawet gatunku). Teoria ta sugeruje, że adaptacje są fenotypowymi skutkami genów, aby zmaksymalizować ich reprezentację w przyszłych pokoleniach. Adaptacja jest utrzymywana przez dobór, jeśli bezpośrednio promuje przetrwanie genetyczne lub jakiś podrzędny cel, który ostatecznie przyczynia się do pomyślnej reprodukcji.

Indywidualny altruizm i egoizm genetyczny

Gen jest jednostką informacji dziedzicznej, która istnieje w wielu fizycznych kopiach na świecie, a która konkretna fizyczna kopia zostanie zreplikowana i powstanie nowe kopie, nie ma znaczenia z punktu widzenia genu. Samolubny gen może być faworyzowany przez selekcję poprzez wytworzenie altruizmu wśród organizmów go zawierających. Pomysł można podsumować w następujący sposób:

Jeśli kopia genu nadaje korzyść B innemu pojazdowi kosztem C jego własnemu pojazdowi, jej kosztowne działanie jest strategicznie korzystne, jeśli pB > C , gdzie p jest prawdopodobieństwem, że kopia genu jest obecna w pojeździe, który przynosi korzyści. Działania o znacznych kosztach wymagają zatem znacznych wartości p . Wysokie wartości p zapewniają dwa rodzaje czynników : pokrewieństwo (pokrewieństwo) i uznanie (zielone brody).

—  Haig, 1997, s. 288

Gen w komórce somatycznej osobnika może zrezygnować z replikacji, aby promować transmisję swoich kopii w komórkach linii zarodkowej. Zapewnia wysoką wartość p=1 ze względu na ich stały kontakt i wspólne pochodzenie z zygoty .

Wybór kin teoria przewiduje, że gen może promować uznanie pokrewieństwa przez historycznej ciągłości: ssaka uczy matki, aby zidentyfikować jej własne potomstwo w akcie urodzenia; samiec preferencyjnie kieruje środki na potomstwo matek, z którym kopulował; pozostałe pisklęta w gnieździe to rodzeństwo; i tak dalej. Oczekiwany altruizm między krewnymi jest kalibrowany przez wartość p , znaną również jako współczynnik pokrewieństwa . Na przykład jednostka ma p = 1/2 w stosunku do swojego brata i p = 1/8 w stosunku do kuzyna, więc ceteris paribus oczekiwalibyśmy większego altruizmu wśród braci niż wśród kuzynów. W tym duchu genetyk JBS Haldane zażartował: „Czy oddałbym życie, aby uratować brata? Nie, ale chciałbym uratować dwóch braci lub ośmiu kuzynów”. Jednakże, badając ludzką skłonność do altruizmu, teoria doboru krewniaczego wydaje się nie być w stanie wyjaśnić międzyrodzinnych, międzyrasowych, a nawet międzygatunkowych aktów dobroci.

Efekt zielonobrody

Efekty zielonobrodego zyskały swoją nazwę od eksperymentu myślowego przedstawionego po raz pierwszy przez Billa Hamiltona, a następnie spopularyzowanego i nadającego obecną nazwę przez Richarda Dawkinsa, który rozważał możliwość istnienia genu, który spowodował, że jego posiadacze rozwinęli zieloną brodę i byli mili dla innych osoby zielonobrodego. Od tego czasu „efekt zielonej brody” zaczął odnosić się do form genetycznego samorozpoznania, w których gen u jednego osobnika może przekazywać korzyści innym osobnikom posiadającym ten gen. Takie geny byłyby szczególnie egoistyczne , czerpiąc korzyści niezależnie od losów ich pojazdów. Od tego czasu w przyrodzie odkryto geny zielonej brody, takie jak Gp-9 u mrówek ognistych ( Solenopsis invicta ), csA u ameby społecznej ( Dictyostelium discoideum ) i FLO1 u pączkujących drożdży ( Saccharomyces cerevisiae ).

Konflikt wewnątrzgenomowy

Ponieważ geny są zdolne do wywoływania indywidualnego altruizmu, są w stanie wywołać konflikt między genami w genomie jednego osobnika. Zjawisko to nazywane jest konfliktem wewnątrzgenomowym i powstaje, gdy jeden gen promuje własną replikację ze szkodą dla innych genów w genomie. Klasycznym przykładem są geny zakłócające segregację, które oszukują podczas mejozy lub gametogenezy i trafiają do ponad połowy funkcjonalnych gamet . Geny te mogą utrzymywać się w populacji nawet wtedy, gdy ich przeniesienie skutkuje zmniejszoną płodnością . Egbert Leigh porównał genom do „parlamentu genów: każdy działa we własnym interesie, ale jeśli jego działania ranią inne, połączą się, aby go stłumić”, aby wyjaśnić stosunkowo niskie występowanie konfliktów wewnątrzgenomowych.

Równanie ceny

Równanie Cena jest kowariancja równanie to matematyczny opis ewolucji i doboru naturalnego. Równanie Price'a zostało wyprowadzone przez George'a R. Price'a , pracującego w Londynie, aby odtworzyć pracę WD Hamiltona dotyczącą doboru krewniaków.

Adwokaci

Oprócz Richarda Dawkinsa i George'a C. Williamsa, inni biolodzy i filozofowie rozwinęli i udoskonalili teorię egoistycznych genów, tacy jak John Maynard Smith , George R. Price, Robert Trivers , David Haig , Helena Cronin , David Hull , Philip Kitcher i Daniela C. Dennetta .

Krytyka

Poglądowi genocentrycznemu sprzeciwili się Ernst Mayr , Stephen Jay Gould , David Sloan Wilson i filozof Elliott Sober . Alternatywny, wielopoziomowy wybór (MLS) był popierany przez EO Wilsona , Davida Sloana Wilsona, Sobera, Richarda E. Michoda i Samira Okashę .

Pisząc w New York Review of Books , Gould scharakteryzował perspektywę genocentryczną jako mylącą księgowość z przyczynowością . Gould postrzega selekcję jako działającą na wielu poziomach i zwraca uwagę na hierarchiczną perspektywę selekcji. Gould nazwał również twierdzenia Samolubnego Gene'u „ścisłym adaptacjonizmem ”, „ultradarwinizmem” i „darwinowskim fundamentalizmem ”, opisując je jako nadmiernie „ redukcjonistyczne ”. Uważał, że teoria ta prowadzi do uproszczonej „algorytmicznej” teorii ewolucji, a nawet do ponownego wprowadzenia zasady teleologicznej . Mayr posunął się nawet do stwierdzenia, że ​​„podstawowa teoria Dawkinsa dotycząca genu będącego przedmiotem ewolucji jest całkowicie niedarwinowska”.

Gould poruszył również kwestię egoistycznych genów w swoim eseju „Grupy opiekuńcze i egoistyczne geny”. Gould przyznał, że Dawkins nie przypisywał świadomego działania genom, ale po prostu używał skrótowej metafory powszechnie spotykanej w pismach ewolucyjnych. Według Goulda fatalną wadą było to, że „niezależnie od tego, ile władzy Dawkins chce przypisać genom, jest jedna rzecz, której nie może im dać – bezpośrednia widoczność doboru naturalnego”. Jednostką selekcji jest raczej fenotyp, a nie genotyp, ponieważ to fenotypy oddziałują ze środowiskiem na styku selekcji naturalnej. Tak więc, podsumowując pogląd Goulda Kim Sterelny , „różnice genów nie powodują zmian ewolucyjnych w populacjach, one rejestrują te zmiany”. Richard Dawkins odpowiedział na tę krytykę w późniejszej książce The Extended Phenotype , w której Gould pomylił genetykę cząstkową z embriologią cząstkową, stwierdzając, że geny „mieszają się”, jeśli chodzi o ich wpływ na rozwój fenotypów, ale nie mieszają się one tak, jak replikują się i łączą z pokolenia na pokolenie.

Od śmierci Goulda w 2002 roku, Niles Eldredge kontynuował kontrargumenty na rzecz doboru naturalnego skoncentrowanego na genach. Eldredge zauważa, że ​​w książce Dawkinsa „ Kapelan diabła” , która została opublikowana tuż przed książką Eldredge’a, „Richard Dawkins komentuje to, co uważa za główną różnicę między jego stanowiskiem a stanowiskiem nieżyjącego już Stephena Jaya Goulda. wizję, że geny odgrywają przyczynową rolę w ewolucji”, podczas gdy Gould (i Eldredge) „postrzega geny jako pasywne rejestratory tego, co działało lepiej niż co”.

Zobacz też

Bibliografia

Źródła